Ny aretin'ny taovam-pisefoana mahery vaika fantatra amin'ny anarana hoe aretina COVID-19 – noho ny otrik'aretina SARS-CoV-2 – dia fantatra fa miparitaka amin'ny alalan'ny tsimokaretina sy ny fifandraisana akaiky.[1]Ny enta-mavesatry ny COVID-19 dia tena henjana tokoa tany Lombardy sy Po Valley (Italiana Avaratra),[2] faritra iray ahitana vovon-tsavony avo be, izay efa fantatra fa miteraka voka-dratsy eo amin'ny fahasalaman'ny olombelona.[3]Ny tarehimarika isam-paritra ho an'i Italia amin'ny datin'ny 12 aprily dia mampiseho fa eo amin'ny 30% amin'ny olona tsara amin'izao fotoana izao dia mbola mipetraka ao Lombardy (manodidina ny 40% raha jerena ny tranga ankapobeny voamarina hatramin'ny fiandohan'ny valan'aretina), arahin'i Emilia Romagna (13,5%). , Piedmont (10,5%), ary Veneto (10%).[2]Ireo faritra efatra ao amin'ny Lohasahan'i Po dia mitentina 80% amin'ny fitambaran'ny maty voarakitra ao Italia ary 65% amin'ny fidirana ao amin'ny Ivon-toeram-pitsaboana.[2]
Ny fikarohana nataon'ny Sekoly Harvard momba ny Fahasalamam-bahoaka dia toa manamafy ny fifandraisana misy eo amin'ny fiakaran'ny tahan'ny PM sy ny taham-pahafatesana noho ny COVID-19 any Etazonia [4] Tamin'ny fifandraisana teo aloha, dia nihevitra izahay fa mety ho SARS-CoV-2. Ny viriosy dia mety ho eo amin'ny particulate matter (PM) mandritra ny fiparitahan'ny otrikaretina, [5,6] mifanaraka amin'ny porofo efa misy.
azo alaina ho an'ny viriosy hafa.[7-15] Na izany aza, ny olana momba ny microbiome mifandray amin'ny PM amin'ny rivotra, indrindra any amin'ny tontolo an-tanàn-dehibe, dia mbola tsy voadinika amin'ny ankapobeny, [16] ary - amin'izao fotoana izao - tsy mbola nisy olona nanao fanadihadiana andrana natao manokana. amin'ny fanamafisana na fanilihana ny fisian'ny SARS-CoV-2 amin'ny PM.
Eto izahay dia manolotra ny valim-panadihadiana voalohany nataonay tamin'ny santionany PM10 an-kalamanjana / an'habakabaka PM10 34 PM10 avy amin'ny toerana indostrialy ao amin'ny Faritanin'i Bergamo, nangonina niaraka tamin'ny santionan'ny rivotra roa samy hafa nandritra ny fe-potoana 3 herinandro, nanomboka ny 21 febroary ka hatramin'ny martsa. faha-13.
Manaraka ny fomba fiasa nofaritan'i Pan et al.tamin'ny taona 2019 (ho an'ny fanangonana, ny haben'ny sombiny ary ny fitiliana ny viriosy entin'ny rivotra), [17] ny santionany PM dia nangonina tamin'ny sivana fibre quartz tamin'ny alàlan'ny fampiasana santionan'ny rivotra gravimetric ambany (38.3 l/min mandritra ny 23 h), mifanaraka amin'ny fomba fanondroana EN12341 :2014 ho an'ny fanaraha-maso PM10.Voafandrika teo amin'ny sivana misy 99.9% mahazatra ny kojakoja madinikafitehirizana aerosol, voatahiry tsara ary aterina any amin'ny laboratoara Applied and Comparative Génomics ao amin'ny Oniversite Trieste.Noho ny toetran'ny “tontolo iainana” ananan'ny santionany, azo inoana fa manankarena amin'ny inhibitors ny polymerase ADN, dia niroso tamin'ny fitrandrahana ny ARN izahay tamin'ny fampiasana ny kitapo mikraoba fecal tany Quick RNA mifanaraka amin'ny karazana sivana.[18]Nahodina ny sivana antsasany, ka ny ilany ambony mitodika any anatiny,ao anaty tavoahangy polypropylène 5 ml, miaraka amin'ireo vakana omena ao anaty kitapo.Avy amin'ny 1 ml voalohany amin'ny lysisbuffer, dia afaka nahazo vahaolana 400 ul izahay, izay nokarakaraina araka izay voafaritra amin'ny protocols mahazatra, ka nahatonga ny eluate farany amin'ny 15 ul.Avy eo, 5 ul no nampiasaina tamin'ny fitiliana SARS-CoV-2.Raha jerena ny niandohan'ny santionany manokana, dia nampiasaina ny qScript XLT 1-Step RT-qPCR ToughMix.[19]Ny rafitra fanamafisam-peo dia ny protocole novolavolain'i Corman et al, navoaka tao amin'ny tranokalan'ny WHO [20].
Ny fitsapana dia natao hanamafisana na hanilihana ny fisian'ny SARS-CoV-2 RNA amin'ny zavatra particulate.Ny famakafakana voalohany dia nampiasa ny "E gene" ho marika molekiola ary namokatra vokatra tsara mahavariana tamin'ny sivana 15 amin'ny 16 na dia eo anelanelan'ny tsingerina 36-38 aza ny Ct.
Taorian'izay dia naveriny ny famakafakana momba ny sivana 6 amin'ireo sivana tsara (efa tsara ho an'ny "gen E") amin'ny fampiasana ny "gen RtDR" ho marika molekiola - izay tena manokana ho an'ny SARS-CoV-2 - mahatratra valiny 5 manan-danja. ny positivity;Ny fitsapana fanaraha-maso hanilihana ny fahatsarana diso dia vita soa aman-tsara ihany koa (sary 1).
Mba hisorohana ny fahataperan'ny fitaovana santionany zara raha misy, dia naterina tany amin'ny Hopitalin'ny Anjerimanontolo eo an-toerana ny RNA sisa nalaina (iray amin'ireo ivon-toeram-pitsaboana nomen'ny Governemanta italiana hanao fitiliana diagnostika SARS-CoV-2), mba hanaovana fanindroany. fitsapana jamba parallèle.Ity laboratoara klinika faharoa ity dia nanandrana ny fitrandrahana RNA 34 ho an'ny fototarazo E, N ary RdRP, mitatitra vokatra tsara 7 ho an'ny iray amin'ireo fototarazo marika telo farafahakeliny, miaraka amin'ny positivity manokana voamarina ho an'ireo marika telo rehetra (sary 2).Noho ny toetran'ny santionany, ary ny fiheverana fa ny santionany dia tsy natao ho an'ny tanjona diagnostika klinika fa natao ho an'ny fitsirihana ny fandotoana ny tontolo iainana (raha raisina ihany koa fa ny sivana dia voatahiry mandritra ny efatra herinandro farafahakeliny alohan'ny hanaovana famakafakana fototarazo molekiola.vokatry ny fanakatonana italiana), azontsika atao ny manamarina fa naneho ara-drariny ny fisian'ny ARN virosy SARS-CoV-2 tamin'ny alàlan'ny fahafantarana ny "gen RtDR" manokana amin'ny sivana 8.Na izany aza, noho ny tsy fahampian'ny fitaovana fanampiny avy amin'ny sivana, dia tsy afaka namerina ny isan'ny fitsapana ampy mba hanehoana ny tsara ho an'ny 3 molekiola marika miaraka.
Ity no porofo voalohany voalohany fa ny SARS-CoV-2 RNA dia mety ho hita amin'ny akora ety ivelany, noho izany dia manoro hevitra fa, amin'ny toetry ny fahamarinan-toeran'ny atmosfera sy ny fifantohana avo amin'ny PM, ny SARS-CoV-2 dia afaka mamorona cluster miaraka amin'ny PM ivelany sy - amin'ny mampihena ny fiparitahan'izy ireo - manatsara ny faharetan'ny viriosy ao amin'ny atmosfera.Fanamafisana fanampiny momba ity savaranonando ityNy porofo dia mitohy, ary tokony ahitana ny fanombanana amin'ny fotoana tena izy momba ny fahaveloman'ny SARS-CoV-2 ary koa ny faharavan'izy io rehefa mipetaka amin'ny akora simika.Amin'izao fotoana izao, tsy misy vinavina azo atao momba ny fifandraisan'ny fisian'ny viriosy amin'ny fivoaran'ny fihanaky ny COVID-19 sy ny PM.Ny olana hafa tokony hodinihina manokana dia ny salan'isan'ny PM amin'ny faranyilaina amin'ny mety ho "effet boost" amin'ny areti-mifindra (raha toa ka voamarina fa ny PM dia mety ho "mpitondra" ho an'ny nuclei droplet viral), na koa ny mety hisian'ny vaksiny vokatry ny fatra kely indrindra amin'ny tokonam-baravaran'ny PM. .
Fig.1 Ny fiolahana fanamafisam-peo amin'ny fototarazo E (A) sy RdRP (B): ny tsipika maitso dia maneho ireo sivana voasedra;tsipika miampitamaneho ny fitrandrahana sivana reference;Ny tsipika mena dia maneho ny fanamafisana ny santionany tsara.
Fig.2.Valiny tsara (marika X) ho an'ny fototarazo E, N ary RdRP azo ho an'ny santionany 34 PM10 rehetrasivana notsapaina tamin'ny famakafakana parallèle faharoa.
Leonardo Setti1, Fabrizio Passarini2, Gianluigi De Gennaro3, Pierluigi Barbieri4, Maria Grazia Perrone5, Massimo Borelli6, Jolanda Palmisani3, Alessia Di Gilio3, Valentina Torboli6, Alberto Pallavicini6, Maurizio Ruscio7, Prisco Piscitelliani8, Prisco Piscitelliani8
1. Dept. Industrial Chemistry, University of Bologna, Viale del Risorgimento - 4, I-40136, Bologna, Italy
e-mail: leonardo.setti@unibo.it
2. Foibe iraisam-pirenena momba ny fikarohana ara-indostrialy “Loharanom-baovao azo havaozina, tontolo iainana, fitomboana manga, angovo”,
University of Bologna, Rimini, Italy e-mail: fabrizio.passarini@unibo.it
3. Dept. of Biology, University “Aldo Moro” of Bari, Bari, Italy
e-mail: gianluigi.degennaro@uniba.it; alessia.digilio@uniba.it; jolanda.palmisani@uniba.it
4. Departemantan'ny Siansa simika sy fanafody, Oniversiten'i Trieste, Trieste, Italia
e-mail: barbierp@units.it
5. Diviziona fikarohana momba ny tontolo iainana, TCR TECORA, Milan, Italia
e-mail: mariagrazia.perrone@tcrtecora.com
6. Departemantan'ny Siansa Fiainana - Oniversiten'i Trieste, Trieste, Italia
e-mail: borelli@units.it; torboli@units.it; pallavic@units.it
7. Division of Laboratory Medicine, University Hospital Giuliano Isontina (ASU GI), Trieste, Italy
email: maurizio.ruscio@asugi.sanita.fvg.it
8. Fikambanana Italiana momba ny fitsaboana ara-tontolo iainana (SIMA), Milan, Italia
e-mail: priscofreedom@hotmail.com; alessandro.miani@unimi.it
9. Departemantan'ny Siansa momba ny Tontolo Iainana sy Poicy, Oniversiten'i Milan, Milan, Italia
e-mail: priscofreedom@hotmail.com; alessandro.miani@unimi.it
Mpanoratra mifanaraka aminy:
Leonardo Setti, Department of Industrial Chemistry, University of Bologna Viale del Risorgimento 4, 40136, Bologna, Italy; e-mail: leonardo.setti@unibo.it
References
1. Fikambanana Iraisam-pirenena Momba ny Fahasalamana, Fomba fifindran'ny viriosy mahatonga ny COVID-19: ny fiantraikan'ny tolo-kevitra momba ny fitandremana ny IPC, fohy siantifika;azo alaina ao amin'ny: https://www.who.int/newsroom/commentaries/detail/modes-of-transmission-of-virus-causing-covid-19-implications-for-ipcprecaution-recommendations (29 martsa 2020)
2. Minisiteran'ny Fahasalamana Italiana, bulletin isan'andro momba ny fivoahan'ny Covid-19 any Italia, hita ao amin'ny http://www.salute.gov.it/imgs/C_17_notizie_4451_0_file.pdf
3. EEA, Sampan-draharaha Eoropeana momba ny tontolo iainana, Tatitra momba ny kalitaon'ny rivotra any Eoropa 2019;No 10/2019;Masoivoho Eoropeana momba ny tontolo iainana: Copenhague, Danemark, availbale amin'ny: https://www.eea.europa.eu/publications/airquality-in-europe-2019
4. Xiao Wu, Rachel C. Nethery, M. Benjamin Sabath, Danielle Braun, Francesca Dominici, Fipoahana amin'ny fahalotoan'ny rivotra sy ny fahafatesan'ny COVID-19 any Etazonia, hita ao amin'ny: https://projects.iq.harvard.edu/ files/covid-pm/files/pm_and_covid_mortality.pdf
5. Fikambanana italiana momba ny fitsaboana ara-tontolo iainana (SIMA), Taratasy Fametrahana ny singa sy ny COVID-19,
azo alaina ao amin'ny: http://www.simaonlus.it/wpsima/wp-content/uploads/2020/03/COVID_19_positionpaper_ENG.pdf
6. Setti L., Passarini F., De Gennaro G., Barbieri P., Perrone MG, Piazzalunga A., Borelli M., Palmisani J., Di Gilio A, Piscitelli P, Miani A., Is there a Plausible Role ho an'ny resaka particulate amin'ny fihanaky ny COVID-19 any Italia Avaratra?, BMJ Rapid Responses, 8 aprily 2020, azo alaina ao amin'ny: https://www.bmj.com/content/368/bmj.m1103/rapid-responses
7. Sedlmaier, N., Hoppenheidt, K., Krist, H., Lehmann, S., Lang, H., Buttner, M. Fiforonan'ny virosin'ny gripa aviavy (AIV) voapoizina amin'ny diky (PM2.5): génôme sy infectibilité fitiliana ary kajy ny immission.Veterinary Microbiology.139, 156-164 (2009)
8. Zhao, Y., Richardson, B., Takle, E., Chai, L., Schmitt, D., Win, H. Ny fifindran'ny rivotra dia mety nanana anjara toerana tamin'ny fihanaky ny valan'aretina gripa aviavy tamin'ny taona 2015. Etazonia.Sci Rep. 9, 11755. https://doi.org/10.1038/s41598-019-47788-z (2019)
9. Ma, Y., Zhou, J., Yang, S., Zhao, Y., Zheng, X. Fanombanana ny fiantraikan'ny zava-mitranga vovoka amin'ny trangan'ny kitrotro any andrefan'i Shina.Tontolo iainana atmosfera.157, 1-9 (2017)
10. Sorensen, JH, Mackay, DKJ, Jensen, C. Ø., Donaldson, AI.Infect., 124, 577–590 (2000)
11. Glostera, J., Alexandersen, S. New Directions: Fifindran'ny rivotra amin'ny virosy virosy amin'ny tongotra sy vava, 38 (3), 503-505 (2004)
12. Reche, I., D'Orta, G., Mladenov, N., Winget, DM, Suttle, CA.Ny Journal ISME.12, 1154-1162 (2018)
13. Qin, N., Liang, P., Wu, C., Wang, G., Xu, Q., Xiong, X., Wang, T., Zolfo, M., Segata, N., Qin, H ., Knight, R., Gilbert, JA, Zhu, TF Longitudinal fanadihadiana momba ny microbiome mifandray amin'ny particulate ao amin'ny megacity.Genome Biology.21, 55 (2020)
14. Zhao, Y., Richardson, B., Takle, E., Chai, L., Schmitt, D., Win, H. Ny fifindran'ny rivotra dia mety manana
Nitana anjara toerana tamin'ny fihanaky ny valan'aretina gripa aviavy mahery vaika tamin'ny taona 2015 tany Etazonia.Sci
Rep. 9, 11755. https://doi.org/10.1038/s41598-019-47788-z (2019)
15. Ma, Y., Zhou, J., Yang, S., Zhao, Y., Zheng, X. Fanombanana ny fiantraikan'ny zava-mitranga vovoka amin'ny trangan'ny kitrotro any andrefan'i Shina.Tontolo iainana atmosfera.157, 1-9 (2017)
16. Jiang, W., Laing, P., Wang, B., Fang, J., Lang, J., Tian, G., Jiang, J., Zhu, TF Optimized DNA extraction and metagenomic sequencing of airborne microbial community .Nat.Protoc.10, 768-779 (2015)
17. Pan, M., Lednicky, JA, Wu, C.-Y., Famoriam-bola, fandrefesana ny poti-javatra sy ny fahitana ireo viriosy entin'ny rivotra.Journal of Applied Microbiology, 127, 1596-1611 (2019)
18. Zymoresearch Ldt, famaritana ny vokatra, hita ao amin'ny: https://www.zymoresearch.com/products/quick-rnafecal-soil-microbe microprep-kit
19. Quantabio Ltd, famaritana ny vokatra, hita ao amin'ny: https://www.quantabio.com/qscript-xlt-1-steprt-qpcr-toughmix
20. Corman, VM, Landt, O., Kaiser, M., Molenkamp, R., Meijer, A., Chu, DK, & Mulders, DG (2020).
Fikarohana ny 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) amin'ny alàlan'ny RT-PCR amin'ny fotoana tena izy.Eurosurveillance, 25(3), hita ao amin'ny:.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6988269/
Original: https://doi.org/10.1101/2020.04.15.20065995
Fotoana fandefasana: Apr-18-2020