SARS-Cov-2 RNA شمالی اٹلی میں برگامو کے ذرات پر پایا گیا: پہلا ابتدائی ثبوت

شدید ایکیوٹ ریسپائریٹری سنڈروم جسے COVID-19 بیماری کہا جاتا ہے – SARS-CoV-2 وائرس کی وجہ سے – سانس کی بوندوں اور قریبی رابطوں کے ذریعے پھیلنے کے لیے پہچانا جاتا ہے۔لومبارڈی اور پو ویلی (شمالی اٹلی) میں COVID-19 کا بوجھ انتہائی شدید تھا،[2] ایک ایسا علاقہ جس کی خصوصیت ذرہ مادّہ کی زیادہ مقدار ہے، جو پہلے ہی انسانی صحت پر منفی اثرات پیدا کرنے کے لیے جانا جاتا ہے۔[3]12 اپریل کی تاریخ کو اٹلی کے لیے دستیاب علاقائی اعداد و شمار بتاتے ہیں کہ فی الحال مثبت لوگوں میں سے تقریباً 30% اب بھی لومبارڈی میں رہتے ہیں (تقریباً 40% اگر وبا کے آغاز سے تصدیق شدہ مجموعی کیسز پر غور کریں)، اس کے بعد ایمیلیا روماگنا (13.5%) پیڈمونٹ (10.5%)، اور وینیٹو (10%)۔پو ویلی کے ان چار علاقوں میں اٹلی میں ریکارڈ ہونے والی کل اموات کا 80% اور انتہائی نگہداشت کے یونٹوں میں 65% داخلے ہوتے ہیں۔

ہارورڈ سکول آف پبلک ہیلتھ کی طرف سے کی گئی ایک تحقیق سے لگتا ہے کہ امریکہ میں COVID-19 کی وجہ سے PM کی تعداد میں اضافے اور اموات کی شرح کے درمیان تعلق کی تصدیق ہوتی ہے وائرس انفیکشن کے پھیلاؤ کے دوران ذرات کے مادے (PM) پر موجود ہوسکتا ہے، [5,6] مسلسل ثبوت کے ساتھ
دوسرے وائرسوں کے لیے دستیاب ہے۔ PM پر SARS-CoV-2 کی موجودگی کی تصدیق یا خارج کرنے پر۔
یہاں، ہم ان تجزیوں کے پہلے نتائج پیش کرتے ہیں جو ہم نے صوبہ برگامو کے ایک صنعتی مقام سے آؤٹ ڈور/ہوائی پی ایم10 کے 34 PM10 نمونوں پر کیے ہیں، جو 21 فروری سے مارچ تک مسلسل 3 ہفتوں کے عرصے میں دو مختلف ہوا کے نمونوں کے ساتھ جمع کیے گئے ہیں۔ 13۔
Pan et al کی طرف سے بیان کردہ طریقہ کار پر عمل کرنا۔2019 میں (ہوا سے پیدا ہونے والے وائرسوں کو جمع کرنے، پارٹیکل سائزنگ کرنے اور ان کا پتہ لگانے کے لیے)، [17] پی ایم کے نمونے کوارٹج فائبر فلٹرز پر کم حجم کے گریوی میٹرک ایئر سیمپلر (23 گھنٹے کے لیے 38.3 لیٹر/منٹ) کا استعمال کرتے ہوئے اکٹھے کیے گئے، حوالہ طریقہ EN12341 کے مطابق :2014 PM10 کی نگرانی کے لیے۔99.9% عام کے ساتھ ذرات کا مادہ فلٹرز میں پھنس گیا تھا۔ایروسول برقرار رکھنا، مناسب طریقے سے ذخیرہ کیا گیا اور ٹریسٹ یونیورسٹی کے اپلائیڈ اور تقابلی جینومکس کی لیبارٹری میں پہنچایا گیا۔نمونے کی "ماحولیاتی" نوعیت کو دیکھتے ہوئے، ممکنہ طور پر ڈی این اے پولیمیریز کے روکنے والوں سے بھرپور، ہم نے فلٹرز کی قسم کے مطابق کوئیک آر این اے فیکل سوائل مائکروب کٹ کا استعمال کرتے ہوئے آر این اے کو نکالنے کے لیے آگے بڑھا۔[18]آدھا فلٹر رول کیا گیا تھا، جس کا اوپری حصہ اندر کی طرف تھا،5 ملی لیٹر پولی پروپیلین ٹیوب میں، کٹ میں فراہم کردہ موتیوں کے ساتھ۔لیس بفر کے ابتدائی 1 ملی لیٹر سے، ہم تقریباً 400 ul حل حاصل کرنے میں کامیاب ہو گئے، جس پر معیاری پروٹوکولز کے مطابق عمل کیا گیا، جس کے نتیجے میں 15 ul کا حتمی حل نکلا۔اس کے بعد، SARS-CoV-2 ٹیسٹنگ کے لیے 5 ul استعمال کیے گئے۔نمونے کی خاص اصلیت کو دیکھتے ہوئے، qScript XLT 1-Step RT-qPCR ToughMix استعمال کیا گیا تھا۔[19]ایمپلیفیکیشن سسٹمز کورمین ایٹ ال کے تیار کردہ پروٹوکول کے تھے، جو ڈبلیو ایچ او کی ویب سائٹ [20] پر شائع ہوئے۔
ٹیسٹ کا مقصد واضح طور پر ذرات پر SARS-CoV-2 RNA کی موجودگی کی تصدیق یا خارج کرنا تھا۔پہلے تجزیے میں "E جین" کو مالیکیولر مارکر کے طور پر استعمال کیا گیا اور 16 میں سے 15 فلٹرز پر ایک متاثر کن مثبت نتیجہ سامنے آیا، چاہے جیسا کہ ہم توقع کر سکتے ہیں، Ct 36-38 سائیکلوں کے درمیان تھا۔
اس کے بعد، ہم نے "RtDR جین" کو مالیکیولر مارکر کے طور پر استعمال کرتے ہوئے مثبت فلٹرز میں سے 6 (پہلے سے ہی "E جین" کے لیے مثبت) پر تجزیہ نقل کیا ہے - جو کہ SARS-CoV-2 کے لیے انتہائی مخصوص ہے - 5 اہم نتائج تک پہنچ رہا ہے۔ مثبتیت کی؛جھوٹی مثبتیت کو خارج کرنے کے لیے کنٹرول ٹیسٹ بھی کامیابی سے کیے گئے (تصویر 1)۔
دستیاب نمونے لینے کے ناقص مواد کے ختم ہونے سے بچنے کے لیے، بقیہ نکالے گئے RNAs کو مقامی یونیورسٹی ہسپتال (ایک طبی مراکز میں سے ایک جسے SARS-CoV-2 تشخیصی ٹیسٹوں کے لیے اطالوی حکومت نے اختیار دیا ہے) پہنچایا، تاکہ ایک سیکنڈ انجام دیا جا سکے۔ متوازی اندھے ٹیسٹ.اس دوسری کلینیکل لیبارٹری نے E, N اور RdRP جینز کے لیے 34 RNA نکالنے کا تجربہ کیا، تینوں مارکر جینز میں سے کم از کم ایک کے لیے 7 مثبت نتائج کی اطلاع دی، تینوں مارکروں کے لیے الگ الگ مثبتیت کی تصدیق کی گئی (تصویر 2)۔نمونے کی نوعیت کی وجہ سے، اور اس بات پر غور کرتے ہوئے کہ نمونے لینے کا عمل طبی تشخیصی مقاصد کے لیے نہیں کیا گیا ہے بلکہ ماحولیاتی آلودگی کے ٹیسٹ کے لیے کیا گیا ہے (اس بات کو بھی مدنظر رکھتے ہوئے کہ مالیکیولر جینیاتی تجزیوں سے پہلے فلٹرز کو کم از کم چار ہفتوں تک ذخیرہ کیا گیا تھا، جیسا کہاطالوی شٹ ڈاؤن کا نتیجہ)، ہم 8 فلٹرز پر انتہائی مخصوص "RtDR جین" کا پتہ لگا کر SARS-CoV-2 وائرل RNA کی موجودگی کا معقول مظاہرہ کرنے کی تصدیق کر سکتے ہیں۔تاہم، فلٹرز سے اضافی مواد کی کمی کی وجہ سے، ہم بیک وقت تمام 3 مالیکیولر مارکروں کے لیے مثبتیت دکھانے کے لیے کافی تعداد میں ٹیسٹ دہرانے کے قابل نہیں تھے۔
یہ پہلا ابتدائی ثبوت ہے کہ SARS-CoV-2 RNA بیرونی ذرات پر موجود ہو سکتا ہے، اس طرح یہ تجویز کرتا ہے کہ، ماحول کے استحکام اور PM کے زیادہ ارتکاز کے حالات میں، SARS-CoV-2 بیرونی PM کے ساتھ کلسٹرز بنا سکتا ہے اور – ان کے پھیلاؤ کے گتانک کو کم کرنا - فضا میں وائرس کی برقراری کو بڑھانا۔اس ابتدائی کی مزید تصدیقشواہد جاری ہیں، اور اس میں SARS-CoV-2 کی جیورنبل کے بارے میں اصل وقتی تشخیص کے ساتھ ساتھ ذرات پر جذب ہونے پر اس کے وائرس کو بھی شامل کرنا چاہیے۔فی الحال، PM پر وائرس کی موجودگی اور COVID-19 پھیلنے کے بڑھنے کے درمیان تعلق کے بارے میں کوئی قیاس نہیں کیا جا سکتا۔دوسرے مسائل جن پر خاص طور پر توجہ دی جانی ہے وہ ہیں بالآخر PM کی اوسط ارتکازمتعدی بیماری کے ممکنہ "بوسٹ اثر" کے لیے ضروری ہے (اگر اس بات کی تصدیق ہو جائے کہ PM وائرل بوندوں کے مرکزے کے لیے "کیرئیر" کے طور پر کام کر سکتا ہے)، یا PM کی نچلی دہلیز پر کم سے کم خوراک کی نمائش کے نتیجے میں حفاظتی ٹیکوں کا نظریاتی امکان بھی۔ .

تصویر.1 E (A) اور RdRP جینز (B) کے ایمپلیفیکیشن منحنی خطوط: سبز لکیریں آزمائشی فلٹرز کی نمائندگی کرتی ہیں۔کراس لائنزحوالہ فلٹر نکالنے کی نمائندگی کرتا ہے؛سرخ لکیریں مثبت نمونوں کی افزائش کی نمائندگی کرتی ہیں۔
تصویر 1

تصویر 2۔تمام 34 PM10 نمونے کے لیے حاصل کردہ E, N اور RdRP جینز کے مثبت نتائج (X کے ساتھ نشان زد)دوسرے متوازی تجزیوں میں جانچے گئے فلٹرز۔
تصویر 2Leonardo Setti1، Fabrizio Passarini2، Gianluigi De Gennaro3، Pierluigi Barbieri4، Maria Grazia Perrone5، Massimo Borelli6، Jolanda Palmisani3، Alessia Di Gilio3، Valentina Torboli6، Alberto Pallavicini6، Maurizio Priscoellis، Micosio 988، اور 8999
1. شعبہ صنعتی کیمسٹری، بولوگنا یونیورسٹی، Viale del Risorgimento – 4, I-40136, Bologna, Italy
e-mail: leonardo.setti@unibo.it
2. انٹر ڈپارٹمنٹل سینٹر فار انڈسٹریل ریسرچ "قابل تجدید ذرائع، ماحولیات، بلیو گروتھ، انرجی"،
University of Bologna, Rimini, Italy e-mail: fabrizio.passarini@unibo.it
3. شعبہ حیاتیات، یونیورسٹی "الڈو مورو" باری، باری، اٹلی
e-mail: gianluigi.degennaro@uniba.it; alessia.digilio@uniba.it; jolanda.palmisani@uniba.it
4. شعبہ کیمیکل اور فارماسیوٹیکل سائنسز، یونیورسٹی آف ٹریسٹ، ٹریسٹ، اٹلی
e-mail: barbierp@units.it
5. ماحولیاتی ریسرچ ڈویژن، TCR TECORA، میلان، اٹلی
e-mail: mariagrazia.perrone@tcrtecora.com
6. شعبہ حیاتیات - یونیورسٹی آف ٹریسٹ، ٹریسٹ، اٹلی
e-mail: borelli@units.it; torboli@units.it; pallavic@units.it
7. لیبارٹری میڈیسن کا ڈویژن، یونیورسٹی ہسپتال Giuliano Isontina (ASU GI)، Trieste، Italy
email: maurizio.ruscio@asugi.sanita.fvg.it
8. اطالوی سوسائٹی آف انوائرمینٹل میڈیسن (SIMA)، میلان، اٹلی
e-mail: priscofreedom@hotmail.com; alessandro.miani@unimi.it
9. شعبہ ماحولیاتی سائنس اور پالیسی، میلان یونیورسٹی، میلان، اٹلی
e-mail: priscofreedom@hotmail.com; alessandro.miani@unimi.it
اسی مصنف:
لیونارڈو سیٹی، Department of Industrial Chemistry, University of Bologna Viale del Risorgimento 4, 40136, Bologna, Italy; e-mail: leonardo.setti@unibo.it

حوالہ جات
1. ورلڈ ہیلتھ آرگنائزیشن، COVID-19 کا سبب بننے والے وائرس کی منتقلی کے طریقے: آئی پی سی کی احتیاطی سفارشات کے مضمرات، سائنسی مختصر؛یہاں دستیاب ہے: https://www.who.int/newsroom/commentaries/detail/modes-of-transmission-of-virus-causing-covid-19-implications-for-ipcprecaution-recommendations (29 مارچ 2020)
2. اطالوی وزارت صحت، روزانہ بلیٹن اٹلی میں CoVID-19 کی وبا، http://www.salute.gov.it/imgs/C_17_notizie_4451_0_file.pdf پر دستیاب ہے۔
3. EEA، یورپی ماحولیاتی ایجنسی، یورپ میں ہوا کا معیار 2019 رپورٹ؛نمبر 10/2019;یورپی ماحولیاتی ایجنسی: کوپن ہیگن، ڈنمارک، یہاں دستیاب ہے: https://www.eea.europa.eu/publications/airquality-in-europe-2019
4. Xiao Wu, Rachel C. Nethery, M. Benjamin Sabath, Danielle Braun, Francesca Dominici, Exposure to air pollution and Covid-19 اموات ریاستہائے متحدہ میں، دستیاب ہے: https://projects.iq.harvard.edu/ files/covid-pm/files/pm_and_covid_mortality.pdf
5. اطالوی سوسائٹی آف انوائرمنٹل میڈیسن (SIMA)، پوزیشن پیپر پارٹیکولیٹ میٹر اور COVID-19،
یہاں دستیاب ہے: http://www.simaonlus.it/wpsima/wp-content/uploads/2020/03/COVID_19_positionpaper_ENG.pdf
6. Setti L.، Passarini F.، De Gennaro G.، Barbieri P.، Perrone MG، Piazzalunga A.، Borelli M.، Palmisani J.، Di Gilio A، Piscitelli P، Miani A.، کیا کوئی قابل فہم کردار ہے؟ شمالی اٹلی میں COVID-19 کے پھیلاؤ میں ذرات کے لیے؟، BMJ ریپڈ ریسپانس، 8 اپریل 2020، یہاں دستیاب ہے: https://www.bmj.com/content/368/bmj.m1103/rapid-responses
7. Sedlmaier, N., Hoppenheidt, K., Krist, H., Lehmann, S., Lang, H., Buttner, M. جنریشن آف ایویئن انفلوئنزا وائرس (AIV) آلودہ فیکل فائن پارٹکیولیٹ میٹر (PM2.5): جینوم اور انفیکشن کا پتہ لگانا اور امیشن کا حساب۔ویٹرنری مائکرو بایولوجی۔139، 156-164 (2009)
8. Zhao, Y., Richardson, B., Takle, E., Chai, L., Schmitt, D., Win, H. ایئر بورن ٹرانسمیشن نے 2015 میں انتہائی پیتھوجینک ایویئن انفلوئنزا کے پھیلنے میں کردار ادا کیا ہو سکتا ہے۔ ریاستہائے متحدہسائنس کا نمائندہ 9، 11755۔ https://doi.org/10.1038/s41598-019-47788-z (2019)
9. Ma, Y., Zhou, J., Yang, S., Zhao, Y., Zheng, X. مغربی چین میں خسرہ کے واقعات پر دھول کے واقعات کے اثرات کا اندازہ۔ماحولیاتی ماحول۔157، 1-9 (2017)
10. Sorensen, JH, Mackay, DKJ, Jensen, C. Ø., Donaldson, AI پاؤں اور منہ کی بیماری وائرس Epidemiol کے ماحولیاتی پھیلاؤ کی پیش گوئی کرنے کے لیے ایک مربوط ماڈل۔انفیکشن، 124، 577-590 (2000)
11. Glostera, J., Alexandersen, S. New Directions: Airborne Transmission of Foot-and-Mouth Disease Virus Atmospheric Environment, 38 (3), 503-505 (2004)
12. Reche, I., D'Orta, G., Mladenov, N., Winget, DM, Suttle, CA وائرس اور بیکٹیریا کے ماحول کی حد کے اوپر جمع ہونے کی شرح۔ISME جرنل۔12، 1154-1162 (2018)
13. کن، این، لیانگ، پی، وو، سی، وانگ، جی، سو، کیو، ژیونگ، ایکس، وانگ، ٹی، زولفو، ایم، سیگاٹا، این، کن، ایچ۔ .، نائٹ، آر.، گلبرٹ، JA، Zhu، TF ایک میگاسٹی میں ذرات کے مادے سے وابستہ مائکرو بایوم کا طولانی سروے۔جینوم بائیولوجی۔21، 55 (2020)
14. Zhao, Y., Richardson, B., Takle, E., Chai, L., Schmitt, D., Win, H. ایربورن ٹرانسمیشن ہو سکتا ہے
ریاستہائے متحدہ میں 2015 کے انتہائی پیتھوجینک ایویئن انفلوئنزا کے پھیلاؤ میں ایک کردار ادا کیا۔سائنس
9، 11755۔ https://doi.org/10.1038/s41598-019-47788-z (2019)
15. Ma, Y., Zhou, J., Yang, S., Zhao, Y., Zheng, X. مغربی چین میں خسرہ کے واقعات پر دھول کے واقعات کے اثرات کا اندازہ۔ماحولیاتی ماحول۔157، 1-9 (2017)
16. جیانگ، ڈبلیو، لانگ، پی.، وانگ، بی، فینگ، جے، لینگ، جے، تیان، جی، جیانگ، جے، جھو، ٹی ایف آپٹمائزڈ ڈی این اے نکالنے اور ہوا سے چلنے والی مائکروبیل کمیونٹیز کی میٹجینومک ترتیب .نیٹپروٹوک10، 768-779 (2015)
17. پین، ایم، لیڈنکی، جے اے، وو، سی.-وائی، جمع، ذرہ سائز اور ہوا سے پیدا ہونے والے وائرس کا پتہ لگانا۔جرنل آف اپلائیڈ مائکرو بایولوجی، 127، 1596-1611 (2019)
18. Zymoresearch Ldt، مصنوعات کی تفصیل، یہاں دستیاب ہے: https://www.zymoresearch.com/products/quick-rnafecal-soil-microbe microprep-kit
19. Quantabio Ltd، پروڈکٹ کی تفصیل، یہاں دستیاب ہے: https://www.quantabio.com/qscript-xlt-1-steprt-qpcr-toughmix
20. Corman, VM, Landt, O., Kaiser, M., Molenkamp, ​​R., Meijer, A., Chu, DK, & Mulders, DG (2020)۔
ریئل ٹائم RT-PCR کے ذریعے 2019 ناول کورونا وائرس (2019-nCoV) کا پتہ لگانا۔یورو سرویلنس، 25(3)، یہاں دستیاب ہے:.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6988269/

اصل: https://doi.org/10.1101/2020.04.15.20065995


پوسٹ ٹائم: اپریل 18-2020