Синдроми шадиди роҳи нафас, ки бо номи бемории COVID-19 маъруф аст - аз сабаби вируси SARS-CoV-2 - эътироф шудааст, ки тавассути қатраҳои роҳи нафас ва тамосҳои наздик паҳн мешавад.[1]Бори COVID-19 дар Ломбардия ва водии По (Итолиёи Шимолӣ),[2], минтақае, ки бо консентратсияи баланди моддаҳои заррае, ки аллакай маълум аст, ба саломатии инсон таъсири манфӣ мерасонад, хеле вазнин буд.[3]Рақамҳои минтақавӣ барои Италия дар санаи 12 апрел нишон медиҳанд, ки тақрибан 30% одамони мусбат дар ҳоли ҳозир дар Ломбардия зиндагӣ мекунанд (тақрибан 40% агар бо назардошти ҳолатҳои умумии аз оғози эпидемия тасдиқшуда), пас аз он Эмилия Романья (13,5%) , Пьемонт (10,5%) ва Венето (10%).[2]Ин чаҳор минтақаи водии По 80% фавти умумии дар Италия сабтшуда ва 65% қабули шӯъбаҳои реаниматсионӣ ба ҳисоб мераванд.[2]
Тадқиқоте, ки аз ҷониби Мактаби Тандурустии Ҷамъиятии Ҳарвард гузаронида шудааст, ба назар мерасад, ки робитаи байни афзоиши консентратсияи PM ва сатҳи фавт аз сабаби COVID-19 дар ИМА тасдиқ карда шудааст[4] Дар муоширати қаблӣ, мо эҳтимолияти SARS-CoV-2-ро тахмин карда будем. вирус метавонад дар моддаҳои заррача (PM) ҳангоми паҳншавии сироят мавҷуд бошад, [5,6] пайваста бо далелҳои аллакай
барои дигар вирусҳо дастрас аст.[7-15] Бо вуҷуди ин, масъалаи микробиомаи бо PM алоқаманд дар ҳаво, махсусан дар муҳити шаҳрӣ, ба таври ҷиддӣ таҳқиқ карда нашудааст,[16] ва дар айни замон ҳеҷ кас тадқиқоти таҷрибавиеро анҷом надодааст. ҳангоми тасдиқ ё истиснои мавҷудияти SARS-CoV-2 дар PM.
Дар ин ҷо мо натиҷаҳои аввалини таҳлилҳоеро пешниҳод менамоем, ки мо дар 34 намунаи PM10-и берунӣ/ҳавоӣ аз як макони саноатии музофоти Бергамо, ки бо ду намунагирандаи гуногуни ҳаво дар тӯли 3 ҳафтаи давомдор аз 21 феврал то март ҷамъоварӣ шудаанд, пешниҳод мекунем. 13.
Пас аз методологияи тавсифкардаи Пан ва дигарон.дар соли 2019 (барои ҷамъоварӣ, андозаи зарраҳо ва ошкор кардани вирусҳои ҳавоӣ),[17] намунаҳои PM дар филтрҳои нахи кварц бо истифода аз намунагирандаи ҳавои камҳаҷми гравиметрӣ (38,3 л/дақ дар давоми 23 соат), ки бо усули истинод EN12341 мувофиқанд, ҷамъоварӣ карда шуданд. : 2014 барои мониторинги PM10.Моддаҳои зарраҳо ба филтрҳо афтода буданд, ки 99,9% хосанднигоҳдории аэрозол, дуруст нигоҳ дошта мешавад ва ба лабораторияи геномикаи амалӣ ва муқоисавии Донишгоҳи Триест интиқол дода мешавад.Бо назардошти хусусияти "муҳитӣ"-и намуна, ки эҳтимолан аз ингибиторҳои полимеразҳои ДНК бой аст, мо истихроҷи РНК-ро бо истифода аз маҷмӯаи микробҳои хоки Quick RNA-и наҷосати ба намуди филтрҳо мутобиқшуда идома додем.[18]Нисфи филтр ғелонда шуд, ки тарафи боло ба дарун нигаронида шудааст,дар найчаи полипропиленӣ 5 мл, дар якҷоягӣ бо маҳтобӣ, ки дар маҷмӯа пешбинӣ шудааст.Аз 1 мл лизисбуфери ибтидоӣ, мо тавонистем тақрибан 400 ул маҳлул ба даст орем, ки пас аз он тибқи протоколҳои стандартӣ коркард карда шуд, ки дар натиҷа элюати ниҳоии 15 ул.Баъдан, 5 ул барои санҷиши SARS-CoV-2 истифода шуд.Бо назардошти пайдоиши хоси намуна, qScript XLT 1-Step RT-qPCR ToughMix истифода шуд.[19]Системаҳои афзоянда протоколҳое буданд, ки аз ҷониби Корман ва дигарон таҳия шудаанд, ки дар вебсайти ТУТ нашр шудаанд [20].
Санҷиш ба таври возеҳ ба тасдиқ ё истисно кардани мавҷудияти РНК SARS-CoV-2 дар моддаҳои зарра нигаронида шудааст.Таҳлили аввал "гени Е" -ро ҳамчун аломати молекулавӣ истифода бурд ва дар 15 аз 16 филтр натиҷаи таъсирбахши мусбат дод, ҳатто агар, тавре ки мо интизор будем, Ct дар байни 36-38 давра буд.
Пас аз он, мо таҳлилро дар 6 филтрҳои мусбӣ (аллакай ба "E ген" мусбат) бо истифода аз "гени RtDR" ҳамчун аломати молекулавӣ такрор кардем, ки барои SARS-CoV-2 хеле хос аст - ба 5 натиҷаи назаррас расид. мусбӣ;санҷишҳои назоратӣ барои истисно кардани мусбати бардурӯғ низ бомуваффақият анҷом дода шуданд (расми 1).
Барои роҳ надодан ба тамом шудани маводи камёби намунавӣ, РНК-ҳои боқимондаи истихроҷшуда ба беморхонаи донишгоҳии маҳаллӣ (яке аз марказҳои клиникие, ки аз ҷониби ҳукумати Италия барои санҷишҳои ташхиси SARS-CoV-2 иҷозат дода шудааст) интиқол дода шуданд, то дуюмин санҷиши нобино параллелӣ.Ин лабораторияи клиникии дуюм 34 истихроҷи РНК-ро барои генҳои E, N ва RdRP санҷида, дар бораи ҳадди аққал яке аз се генҳои маркер 7 натиҷаи мусбӣ гузориш дод, ки мусбӣ барои ҳар се маркер алоҳида тасдиқ шудааст (расми 2).Бо назардошти хусусияти намуна ва бо назардошти он, ки интихоб на бо мақсади ташхиси клиникӣ, балки барои санҷишҳои ифлосшавии муҳити зист гузаронида шудааст (инчунин ба назар гирифтани он, ки филтрҳо на камтар аз чор ҳафта пеш аз гузаронидани таҳлилҳои генетикии молекулавӣ нигоҳ дошта мешаванд, ҳамчуннатиҷаи қатъи Италия), мо метавонем тасдиқ кунем, ки мавҷудияти РНК вирусии SARS-CoV-2-ро тавассути ошкор кардани "гени RtDR" дар 8 филтр ба таври оқилона нишон дод.Аммо, аз сабаби набудани маводи иловагӣ аз филтрҳо, мо натавонистем шумораи кофии санҷишҳоро такрор кунем, то дар як вақт барои ҳамаи 3 аломати молекулавӣ мусбӣ нишон диҳем.
Ин аввалин далели пешакии он аст, ки SARS-CoV-2 РНК метавонад дар моддаҳои зарраҳои беруна мавҷуд бошад ва аз ин рӯ нишон медиҳад, ки дар шароити устувории атмосфера ва консентратсияи баланди PM, SARS-CoV-2 метавонад кластерҳоро бо PM дар берун эҷод кунад ва кам кардани коэффи-циенти диффузияи онхо — устувории вирусро дар атмосфера зиёд мекунад.Тасдиқҳои минбаъдаи ин пешакӣдалелҳо идома доранд ва бояд арзёбии воқеиро дар бораи ҳаётбахшии SARS-CoV-2 ва инчунин зӯроварии он ҳангоми адсорбсия дар моддаҳои зарраҳо дар бар гиранд.Дар айни замон, ҳеҷ гуна фарзия дар бораи таносуби мавҷудияти вирус дар PM ва пешрафти хуруҷи COVID-19 вуҷуд надорад.Масъалаҳои дигаре, ки бояд махсусан ҳал карда шаванд, дар ниҳоят консентратсияи миёнаи PM мебошандбарои "таъсири афзояндаи" эҳтимолии сироят талаб карда мешавад (агар тасдиқ карда шавад, ки PM метавонад ҳамчун "интиқолдиҳанда" барои ядроҳои қатраҳои вирусӣ амал кунад) ё ҳатто имкони назариявии иммунизатсия дар натиҷаи таъсири ҳадди ақали вояи дар ҳадди поёнтари PM. .
Расми 1 Каҷҳои пурқувваткунии генҳои E (A) ва RdRP (B): хатҳои сабз филтрҳои санҷидашударо нишон медиҳанд;хатҳои салибистихроҷи филтри истинодро ифода мекунад;хатҳои сурх тақвияти намунаҳои мусбатро ифода мекунанд.
Расми 2.Натиҷаҳои мусбӣ (бо X нишон дода шудаанд) барои генҳои E, N ва RdRP, ки барои ҳама намунаи 34 PM10 гирифта шудаандфилтрҳо, ки дар таҳлилҳои параллели дуюм санҷида шудаанд.
Леонардо Сетти1, Фабрицио Пасарини2, Ҷанлуиҷи Де Женнаро3, Пьерлуиҷи Барбиери4, Мария Грациа Перроне5, Массимо Борелли6, Жоланда Палмисани3, Алессия Ди Гилио3, Валентина Торболи6, Алберто Паллавичини6, Маурицио А.
1. Кафедраи химияи саноатӣ, Донишгоҳи Болония, Виале дел Рисоргименто – 4, I-40136, Болонья, Италия
e-mail: leonardo.setti@unibo.it
2. Маркази байниидоравии тадқиқоти саноатӣ «Манбаъҳои барқароршаванда, муҳити зист, рушди кабуд, энергетика»,
University of Bologna, Rimini, Italy e-mail: fabrizio.passarini@unibo.it
3. Кафедраи биология, Донишгоҳи «Алдо Моро»-и Бари, Бари, Италия
e-mail: gianluigi.degennaro@uniba.it; alessia.digilio@uniba.it; jolanda.palmisani@uniba.it
4. Кафедраи илмҳои химия ва фармасевтии Донишгоҳи Триест, Триест, Италия
e-mail: barbierp@units.it
5. Шӯъбаи тадқиқоти муҳити зист, TCR TECORA, Милан, Италия
e-mail: mariagrazia.perrone@tcrtecora.com
6. Бахши илмҳои ҳаёт – Донишгоҳи Триест, Триест, Италия
e-mail: borelli@units.it; torboli@units.it; pallavic@units.it
7. Шӯъбаи тибби лабораторӣ, беморхонаи донишгоҳӣ Ҷулиано Исонтина (ASU GI), Триест, Италия
email: maurizio.ruscio@asugi.sanita.fvg.it
8. Ҷамъияти итолиёвии тибби экологӣ (SIMA), Милан, Италия
e-mail: priscofreedom@hotmail.com; alessandro.miani@unimi.it
9. Кафедраи илмҳои муҳити зист ва Пойси, Донишгоҳи Милан, Милан, Италия
e-mail: priscofreedom@hotmail.com; alessandro.miani@unimi.it
Муаллиф:
Леонардо Сетти, Department of Industrial Chemistry, University of Bologna Viale del Risorgimento 4, 40136, Bologna, Italy; e-mail: leonardo.setti@unibo.it
Иқтибосҳо
1. Созмони Умумиҷаҳонии Тандурустӣ, Усулҳои интиқоли вируси боиси COVID-19: Оқибатҳо барои тавсияҳои эҳтиётии IPC, Хулосаи илмӣ;дастрас дар: https://www.who.int/newsroom/commentaries/detail/modes-of-transmission-of-virus-causing-covid-19-implications-for-ipcprecaution-recommendations (29 марти соли 2020)
2. Вазорати тандурустии Италия, бюллетени ҳаррӯзаи хуруҷи Ковид-19 дар Италия, дастрас дар http://www.salute.gov.it/imgs/C_17_notizie_4451_0_file.pdf
3. EEA, Агентии Аврупо оид ба муҳити зист, Ҳисобот оид ба сифати ҳаво дар Аврупо 2019;№ 10/2019;Агентии Аврупо оид ба муҳити зист: Копенгаген, Дания, дастрас дар: https://www.eea.europa.eu/publications/airquality-in-europe-2019
4. Xiao Wu, Rachel C. Nethery, M. Benjamin Sabath, Danielle Braun, Francesca Dominici, Exposure to ифлосшавии ҳаво ва фавти COVID-19 дар Иёлоти Муттаҳида, дастрас дар: https://projects.iq.harvard.edu/ files/covid-pm/files/pm_and_covid_mortality.pdf
5. Ҷамъияти тибби экологии Италия (SIMA), Мавқеи коғази заррачаҳо ва COVID-19,
дастрас дар: http://www.simaonlus.it/wpsima/wp-content/uploads/2020/03/COVID_19_positionpaper_ENG.pdf
6. Сетти Л., Пассарини Ф., Де Женнаро Г., Барбиери П., Перроне М.Г., Пиаззалунга А., Борелли М., Палмисани Ҷ., Ди Гилио А, Писсителли П, Миани А., Оё нақши қобили эътимод вуҷуд дорад барои моддаҳои зарраҳо дар паҳншавии COVID-19 дар шимоли Италия?, BMJ Rapid Responses, 8 апрели соли 2020, дастрас дар: https://www.bmj.com/content/368/bmj.m1103/rapid-responses
7. Sedlmaier, N., Hoppenheidt, K., Krist, H., Lehmann, S., Lang, H., Buttner, M. Насли вируси зукоми парранда (AIV) моддаҳои заррачаҳои хуби наҷосати олудашуда (PM2.5): ошкор кардани геном ва сироят ва ҳисоб кардани иммиссия.Микробиологияи байторӣ.139, 156-164 (2009)
8. Zhao, Y., Richardson, B., Takle, E., Chai, L., Schmitt, D., Win, H. Интиқоли ҳавоӣ метавонад дар паҳншавии авҷгирии зукоми парранда хеле патогенӣ дар соли 2015 нақш дошта бошад. Штатхои Муттахида.Sci Rep. 9, 11755. https://doi.org/10.1038/s41598-019-47788-z (2019)
9. Ma, Y., Zhou, J., Yang, S., Zhao, Y., Zheng, X. Арзёбии таъсири ҳодисаҳои чанг ба бемории сурхак дар ғарби Чин.Муҳити атмосфера.157, 1-9 (2017)
10. Sorensen, JH, Mackay, DKJ, Jensen, C. Ø., Donaldson, AI Модели ҳамгирошуда барои пешгӯии паҳншавии атмосферии вируси эпидемияи бемории пой ва даҳон.Инфекция., 124, 577–590 (2000)
11. Glostera, J., Alexandersen, S. Самтҳои нав: Интиқоли вируси пиёла ва даҳон тавассути ҳаво дар муҳити атмосфера, 38 (3), 503-505 (2004)
12. Рече, И., Д'Орта, Г., Младенов, Н., Вингет, ДМ, Саттл, CA. Суръати чойгиршавии вирусхо ва бактерияхо дар болои кабати сархадии атмосфера.Маҷаллаи ISME.12, 1154-1162 (2018)
13. Цин, Н., Лян, П., Ву, Ц., Ван, Г., Сю, К., Сионг, X., Ванг, Т., Золфо, М., Сегата, Н., Цин, Х. ., Найт, Р., Гилберт, Ҷ.А., Чжу, ТФ Тадқиқоти дарозии микробиома, ки бо моддаҳои заррача дар як мегашаҳр алоқаманд аст.Биологияи геном.21, 55 (2020)
14. Чжао, Ю., Ричардсон, Б., Такл, Э., Чай, Л., Шмитт, Д., Вин, Х. Интиқоли ҳавоӣ метавонад дошта бошад.
дар паҳншавии хуруҷи зукоми паррандаи хеле патогении соли 2015 дар Иёлоти Муттаҳида нақш бозидааст.Илм
Намояндагии 9, 11755. https://doi.org/10.1038/s41598-019-47788-z (2019)
15. Ma, Y., Zhou, J., Yang, S., Zhao, Y., Zheng, X. Арзёбии таъсири ҳодисаҳои чанг ба бемории сурхак дар ғарби Чин.Муҳити атмосфера.157, 1-9 (2017)
16. Jiang, W., Laing, P., Wang, B., Fang, J., Lang, J., Tian, G., Jiang, J., Zhu, TF Истихроҷи оптимизатсияи ДНК ва пайдарпайии метагеномии ҷамоатҳои микробҳои ҳавоӣ .Нат.Проток.10, 768-779 (2015)
17. Pan, M., Lednicky, JA, Wu, C.-Y., Ҷамъоварӣ, андозаи зарраҳо ва ошкор кардани вирусҳои ҳавоӣ.Маҷаллаи микробиологияи амалӣ, 127, 1596-1611 (2019)
18. Zymoresearch Ldt, тавсифи маҳсулот, дастрас дар: https://www.zymoresearch.com/products/quick-rnafecal-soil-microbe microprep-kit
19. Quantabio Ltd, тавсифи маҳсулот, дастрас дар: https://www.quantabio.com/qscript-xlt-1-steprt-qpcr-toughmix
20. Корман, В.М., Ландт, О., Кайзер, М., Моленкамп, Р., Мейжер, А., Чу, ДК, ва Мулдерс, ДГ (2020).
Муайян кардани коронавируси нави 2019 (2019-nCoV) тавассути RT-PCR дар вақти воқеӣ.Eurosurveillance, 25(3), дастрас дар:.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6988269/
Асл: https://doi.org/10.1101/2020.04.15.20065995
Вақти фиристодан: апрел-18-2020