Хойд Италийн Бергамогийн тоосонцороос SARS-Cov-2 РНХ олдсон: Анхны урьдчилсан нотолгоо

SARS-CoV-2 вирусын улмаас үүссэн COVID-19 өвчин гэгддэг амьсгалын замын цочмог цочмог хам шинж нь амьсгалын замын дусал болон ойрын хавьтлаар дамждаг болохыг хүлээн зөвшөөрдөг.[1]Хүний эрүүл мэндэд сөрөг нөлөө үзүүлдэг нь аль хэдийн мэдэгдэж байгаа тоосонцор их хэмжээгээр агуулагддаг Ломбарди болон По хөндийд (Хойд Итали)[2] COVID-19-ийн дарамт маш хүнд байсан.[3]Дөрөвдүгээр сарын 12-ны өдрийн Итали улсын бүс нутгийн тоо баримтаас харахад одоогийн эерэг хүмүүсийн 30 орчим хувь нь Ломбардид амьдардаг (хэрэв тахлын эхэн үеэс батлагдсан нийт тохиолдлыг авч үзвэл 40 орчим хувь), дараа нь Эмилия Романья (13.5%). , Пьемонт (10.5%), Венето (10%).[2]По хөндийн эдгээр дөрвөн бүс нь Италид бүртгэгдсэн нийт нас баралтын 80%, эрчимт эмчилгээний тасагт хэвтэн эмчлүүлж буй хүмүүсийн 65%-ийг эзэлж байна.[2]

Харвардын Нийгмийн Эрүүл Мэндийн Сургуулийн хийсэн судалгаагаар АНУ-д COVID-19-ийн улмаас PM-ийн концентраци ихсэх болон нас баралтын түвшин хоорондын хамаарлыг баталж байгаа бололтой[4] Өмнөх мэдээллүүд дээр бид SARS-CoV-2 гэсэн таамаглал дэвшүүлж байсан. Халдвар тархах явцад тоосонцор (PM) дээр вирус байж болно,[5,6] нь аль хэдийн нотлох баримттай нийцэж байна.
бусад вирүст боломжтой.[7-15] Гэсэн хэдий ч агаарын дуслаар дамждаг РМ-тэй холбоотой микробиомын асуудал, ялангуяа хотын орчинд ихээхэн дутуу судлагдаагүй хэвээр байгаа бөгөөд [16] одоогоор хэн ч тусгайлан чиглэсэн туршилтын судалгаа хийгээгүй байна. PM дээр SARS-CoV-2 байгаа эсэхийг батлах эсвэл үгүйсгэх үед.
Бид 2-р сарын 21-ээс 3-р сарын хооронд тасралтгүй 3 долоо хоногийн турш хоёр өөр агаарын дээж авагчид цуглуулсан Бергамо мужийн аж үйлдвэрийн талбайгаас гадаа/агаар дахь PM10-ийн 34 дээжинд хийсэн шинжилгээний эхний үр дүнг танилцуулж байна. 13 дахь.
Пан нар тодорхойлсон аргачлалын дагуу.2019 онд (агаарт дусаах вирусыг цуглуулах, тоосонцорыг тодорхойлох, илрүүлэхэд)[17] PM дээжийг EN12341 стандартын стандартын дагуу бага эзэлхүүнтэй гравиметрийн агаарын дээж авагч (23 цагийн турш 38.3 л/мин) ашиглан кварц шилэн шүүлтүүр дээр цуглуулсан. :2014 онд PM10-ийн мониторинг хийх.Шүүлтүүрүүд дээр тоосонцор 99.9% -ийн хувьд хуримтлагдсанаэрозолийг хадгалах, зохих ёсоор хадгалж, Триестийн их сургуулийн Хэрэглээний болон харьцуулсан геномикийн лабораторид хүргэнэ.ДНХ полимеразын дарангуйлагчаар баялаг дээжийн “байгаль орчны” шинж чанарыг харгалзан бид шүүлтүүрийн төрөлд тохируулсан Түргэн РНХ ялгадастай хөрсний микробын иж бүрдлийг ашиглан РНХ-г гаргаж авсан.[18]Хагас шүүлтүүрийг дээд тал нь дотогшоо харсан өнхрүүлсэн.иж бүрдэлд өгөгдсөн бөмбөлгүүдийгтэй хамт 5 мл полипропилен хоолойд хийнэ.Эхний 1 мл лизисбуферээс бид 400 ul уусмал авч чадсан бөгөөд дараа нь стандарт протоколоор тодорхойлогдсоны дагуу боловсруулж, 15 ul-ийн эцсийн шүүрлийг гаргав.Дараа нь SARS-CoV-2 шинжилгээнд 5 ul ашигласан.Дээжийн тодорхой гарал үүслийг харгалзан qScript XLT 1-Step RT-qPCR ToughMix ашигласан.[19]Олшруулах системүүд нь ДЭМБ-ын вэб сайтад нийтлэгдсэн Корман нар боловсруулсан протоколын системүүд байсан [20].
Туршилт нь тоосонцор дээр SARS-CoV-2 РНХ байгаа эсэхийг батлах эсвэл үгүйсгэх зорилготой байв.Эхний шинжилгээнд "Е ген"-ийг молекулын маркер болгон ашигласан бөгөөд бидний таамаглаж байсанчлан Ct нь 36-38 мөчлөгийн хооронд байсан ч 16 шүүлтүүрийн 15-д нь гайхалтай эерэг үр дүнг өгсөн.
Үүний дараа бид SARS-CoV-2-ын хувьд маш өвөрмөц шинж чанартай RtDR генийг молекулын маркер болгон ашиглан эерэг шүүлтүүрийн 6 ("Е ген"-д аль хэдийн эерэг) шинжилгээг давтан хийснээр 5 чухал үр дүнд хүрсэн. эерэг байдал;худал эерэг гарахгүй байх хяналтын тестүүд мөн амжилттай хийгдсэн (Зураг 1).
Боломжит ховор дээж авах материал дуусахаас зайлсхийхийн тулд үлдсэн олборлосон РНХ-ийг орон нутгийн их сургуулийн эмнэлэгт (Италийн засгийн газраас SARS-CoV-2 оношилгооны шинжилгээ хийх зөвшөөрөл олгосон клиник төвүүдийн нэг) хоёр дахь удаагаа хийх зорилгоор хүргэсэн. зэрэгцээ сохор туршилт.Энэхүү эмнэлзүйн хоёр дахь лаборатори нь E, N, RdRP генийн 34 РНХ олборлолтыг туршиж, гурван маркер генийн аль нэгнийх нь хувьд 7 эерэг үр дүнг мэдээлсэн бөгөөд эерэг нь бүх гурван маркерын хувьд тус тусад нь батлагдсан (Зураг 2).Дээжний шинж чанараас шалтгаалан дээжийг эмнэлзүйн оношилгооны зорилгоор биш, харин хүрээлэн буй орчны бохирдлын шинжилгээнд зориулж хийсэн болохыг харгалзан (мөн шүүлтүүрийг молекул генетикийн шинжилгээнд хамрагдахаас өмнө дор хаяж дөрвөн долоо хоног хадгалсан гэдгийг харгалзан үзнэ).Италийн хаалтын үр дагавар) бид 8 шүүлтүүр дээр өндөр өвөрмөц "RtDR ген" илрүүлснээр SARS-CoV-2 вирусын РНХ байгаа эсэхийг үндэслэлтэй нотолж чадна.Гэсэн хэдий ч шүүлтүүрийн нэмэлт материал байхгүйн улмаас бид бүх 3 молекулын тэмдэглэгээг нэгэн зэрэг эерэгээр харуулах хангалттай тооны туршилтыг давтаж чадаагүй.
Энэ нь SARS-CoV-2 РНХ нь гадаа тоосонцор дээр байж болохыг нотлох анхны урьдчилсан нотолгоо бөгөөд ингэснээр агаар мандлын тогтвортой байдал, РМ-ийн өндөр концентрацитай нөхцөлд SARS-CoV-2 нь гадаа PM-тэй кластер үүсгэж болохыг харуулж байна. Тэдний тархалтын коэффициентийг багасгах - агаар мандалд вирусын тогтвортой байдлыг нэмэгдүүлэх.Энэхүү урьдчилсан дүгнэлтийн нэмэлт баталгаанотлох баримтууд үргэлжилж байгаа бөгөөд SARS-CoV-2-ийн амьдрах чадвар, тоосонцор дээр шингэсэн хоруу чанарын талаарх бодит цагийн үнэлгээг багтаасан байх ёстой.Одоогийн байдлаар PM дээр вирус байгаа эсэх болон COVID-19-ийн дэгдэлтийн явц хоорондын хамаарлын талаар ямар ч таамаг дэвшүүлэх боломжгүй байна.Ялангуяа шийдвэрлэх ёстой бусад асуудлууд нь эцсийн эцэст PM-ийн дундаж концентраци юмХалдварт өртөх магадлалтай (хэрэв PM нь вирусын дусал бөөмийг зөөвөрлөх чадвартай болох нь батлагдсан тохиолдолд), тэр ч байтугай PM-ийн доод босгонд хамгийн бага тунгаар өртсөний үр дүнд дархлаажуулалтын онолын боломж. .

Зураг 1 E (A) ба RdRP генийн (B) олшруулалтын муруй: ногоон шугамууд нь шалгагдсан шүүлтүүрийг илэрхийлдэг;хөндлөн шугамлавлагаа шүүлтүүрийн олборлолтыг төлөөлдөг;улаан шугамууд нь эерэг дээжийн олшруулалтыг илэрхийлдэг.
Зураг 1

Зураг 2.Бүх 34 PM10 дээжинд авсан E, N болон RdRP генийн эерэг үр дүн (X тэмдэглэгдсэн)хоёр дахь зэрэгцээ шинжилгээнд туршсан шүүлтүүрүүд.
Зураг 2Леонардо Сетти1, Фабрицио Пассарини2, Жанлуижи Де Женнаро3, Пьерлуижи Барбиери4, Мария Грациа Перроне5, Массимо Борелли6, Жоланда Палмисани3, Алессиа Ди Гилио3, Валентина Торболи6, Альберто Паллавичини6, Маурицио А.
1. Болоньягийн их сургуулийн үйлдвэрлэлийн химийн тэнхим, Виале дель Рисоргименто – 4, I-40136, Болонья, Итали
e-mail: leonardo.setti@unibo.it
2. “Сэргээгдэх эх үүсвэр, байгаль орчин, хөх өсөлт, эрчим хүч” аж үйлдвэрийн судалгааны газар хоорондын төв
University of Bologna, Rimini, Italy e-mail: fabrizio.passarini@unibo.it
3. Италийн Бари, Бари хотын “Альдо Моро” их сургуулийн Биологийн тэнхим
e-mail: gianluigi.degennaro@uniba.it; alessia.digilio@uniba.it; jolanda.palmisani@uniba.it
4. Итали, Триест хотын Триестийн их сургуулийн Хими, эм зүйн шинжлэх ухааны тэнхим
e-mail: barbierp@units.it
5. Байгаль орчны судалгааны хэлтэс, TCR TECORA, Милан, Итали
e-mail: mariagrazia.perrone@tcrtecora.com
6. Амьдралын шинжлэх ухааны тэнхим – Итали, Триест хотын Триестийн их сургууль
e-mail: borelli@units.it; torboli@units.it; pallavic@units.it
7. Жулиано Исонтина их сургуулийн эмнэлгийн лабораторийн анагаах ухааны хэлтэс (ASU GI), Триест, Итали
email: maurizio.ruscio@asugi.sanita.fvg.it
8. Италийн хүрээлэн буй орчны анагаах ухааны нийгэмлэг (SIMA), Милан, Итали
e-mail: priscofreedom@hotmail.com; alessandro.miani@unimi.it
9. Итали, Милан хот, Милан хотын их сургуулийн Байгаль орчны шинжлэх ухаан ба Полици тэнхим
e-mail: priscofreedom@hotmail.com; alessandro.miani@unimi.it
Корреспондент:
Леонардо Сетти, Department of Industrial Chemistry, University of Bologna Viale del Risorgimento 4, 40136, Bologna, Italy; e-mail: leonardo.setti@unibo.it

Лавлагаа
1. Дэлхийн Эрүүл Мэндийн Байгууллага, COVID-19 үүсгэгч вирусын халдвар дамжих арга замууд: IPC-ийн урьдчилан сэргийлэх зөвлөмжид үзүүлэх нөлөө, Шинжлэх ухааны товч мэдээлэл;: https://www.who.int/newsroom/commentaries/detail/modes-of-transmission-of-virus-causing-covid-19-implications-for-ipcprecaution-recommendations (2020 оны 3-р сарын 29)
2. Италийн Эрүүл мэндийн яам, Итали дахь Ковид-19 дэгдэлтийн талаарх өдөр тутмын мэдээллийн товхимол, http://www.salute.gov.it/imgs/C_17_notizie_4451_0_file.pdf
3. EEA, Европын Байгаль орчны агентлаг, Европ дахь агаарын чанарын 2019 оны тайлан;Үгүй 10/2019;Европын Байгаль орчны агентлаг: Копенгаген, Дани, эндээс авах боломжтой: https://www.eea.europa.eu/publications/airquality-in-europe-2019
4. Шиао Ву, Рэйчел С.Нетери, М.Бенжамин Сабат, Даниэлл Браун, Франческа Доминичи, АНУ-ын агаарын бохирдол болон COVID-19-ийн нас баралтыг: https://projects.iq.harvard.edu/ хаягаар авах боломжтой. files/covid-pm/files/pm_and_covid_mortality.pdf
5. Италийн Байгаль орчны Анагаах Ухааны Нийгэмлэг (SIMA), Байршлын цаасны тоосонцор ба COVID-19,
эндээс авах боломжтой: http://www.simaonlus.it/wpsima/wp-content/uploads/2020/03/COVID_19_positionpaper_ENG.pdf
6. Setti L., Passarini F., De Gennaro G., Barbieri P., Perrone MG, Piazzalunga A., Borelli M., Palmisani J., Di Gilio A, Piscitelli P, Miani A., Байна уу? Хойд Итали дахь COVID-19-ийн тархалт дахь тоосонцрын бодисын талаар, BMJ Rapid Responses, 2020 оны 4-р сарын 8, дараах хаягаас үзнэ үү: https://www.bmj.com/content/368/bmj.m1103/rapid-responses
7. Sedlmaier, N., Hoppenheidt, K., Krist, H., Lehmann, S., Lang, H., Buttner, M. Шувууны томуугийн вирүсийн (AIV) бохирдсон өтгөний нарийн ширхэгтэй тоосонцор (PM2.5) үүсэх: геном ба халдвар илрүүлэх, иммиссийг тооцоолох.Мал эмнэлгийн микробиологи.139, 156-164 (2009)
8. Жао, Ю., Ричардсон, Б., Такл, Э., Чай, Л., Шмитт, Д., Вин, Х. 2015 онд гарсан шувууны томуугийн өндөр эмгэг төрүүлэгч дэгдэлтийн тархалтад агаар дуслын халдвар нөлөөлсөн байж болзошгүй. Нэгдсэн Улс.Sci Rep. 9, 11755. https://doi.org/10.1038/s41598-019-47788-z (2019)
9. Ма, Ю., Жоу, Ж., Ян, С., Жао, Ю., Жэн, X. Хятадын баруун хэсэгт улаанбурхан өвчний тархалтад тоосны үйл явдлын нөлөөллийн үнэлгээ.Агаар мандлын орчин.157, 1-9 (2017)
10. Sorensen, JH, Mackay, DKJ, Jensen, C. Ø., Donaldson, AI. Шүлхий вирүсийн эпидемиолын агаар мандалд тархалтыг урьдчилан таамаглах нэгдсэн загвар.Infect., 124, 577–590 (2000)
11. Glostera, J., Alexandersen, S. New Directions: Агаар дуслаар шүлхий вирусын халдвар дамжих, 38 (3), 503-505 (2004)
12. Reche, I., D'Orta, G., Mladenov, N., Winget, DM, Suttle, CA Агаар мандлын хилийн давхарга дээрх вирус, бактерийн хуримтлалын хурд.ISME сэтгүүл.12, 1154-1162 (2018)
13. Цинь, Н., Лян, П., Ву, Ц., Ван, Г., Сю, К., Сион, X., Ван, Т., Золфо, М., Сегата, Н., Цин, Х. ., Найт, Р., Гилберт, Ж.А., Жу, ТФ Мега хот дахь тоосонцортой холбоотой микробиомын уртын судалгаа.Геномын биологи.21, 55 (2020)
14. Жао, Ю., Ричардсон, Б., Такл, Э., Чай, Л., Шмитт, Д., Вин, Х. Агаар дуслаар дамжих боломжтой.
2015 онд АНУ-д өндөр эмгэг төрүүлэгч шувууны томуугийн дэгдэлт тархахад чухал үүрэг гүйцэтгэсэн.Шинжлэх ухаан
Rep. 9, 11755. https://doi.org/10.1038/s41598-019-47788-z (2019)
15. Ма, Ю., Жоу, Ж., Ян, С., Жао, Ю., Жэн, X. Хятадын баруун хэсэгт улаанбурхан өвчний тархалтад тоосны үйл явдлын нөлөөллийн үнэлгээ.Агаар мандлын орчин.157, 1-9 (2017)
16. Jiang, W., Laing, P., Wang, B., Fang, J., Lang, J., Tian, ​​G., Jiang, J., Zhu, TF. Агаар дахь бичил биетний бүлгүүдийн ДНХ-ийн олборлолт ба метагеномик дараалалыг оновчтой болгох. .Нат.Проток.10, 768-779 (2015)
17. Pan, M., Lednicky, JA, Wu, C.-Y., Цуглуулга, бөөмийн хэмжээ, агаараар дамжих вирус илрүүлэх.Хэрэглээний микробиологийн сэтгүүл, 127, 1596-1611 (2019)
18. Zymoresearch Ldt, бүтээгдэхүүний тодорхойлолт, эндээс авах боломжтой: https://www.zymoresearch.com/products/quick-rnafecal-soil-microbe microprep-kit
19. Quantabio Ltd, бүтээгдэхүүний тайлбарыг: https://www.quantabio.com/qscript-xlt-1-steprt-qpcr-toughmix дээрээс авах боломжтой.
20. Корман, В.М., Ландт, О., Кайзер, М., Моленкамп, Р., Мэйжер, А., Чу, ДК, Мулдерс, Д.Г. (2020).
2019 оны шинэ төрлийн коронавирусыг (2019-nCoV) бодит цагийн RT-ПГУ-аар илрүүлсэн.Eurosurveillance, 25(3), эндээс авах боломжтой:.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6988269/

Эх: https://doi.org/10.1101/2020.04.15.20065995


Шуудангийн цаг: 2020 оны 4-р сарын 18