SARS-CoV-2 вирусунан улам COVID-19 оорусу деп аталган катуу курч респиратордук синдром дем алуу тамчылары жана жакын байланыштар аркылуу тарай тургандыгы белгилүү.[1]COVID-19 оорчулугу Ломбардия менен По өрөөнүндө (Түндүк Италия)[2] өтө оор болгон, бул аймак адамдын ден соолугуна терс таасирин тийгизгени белгилүү болгон бөлүкчөлөрдүн жогорку концентрациясы менен мүнөздөлөт.[3]12-апрелге карата Италияда болгон аймактык сандар азыркы учурда позитивдүү адамдардын 30%га жакыны дагы эле Ломбардияда жашаарын (эпидемия башталгандан бери тастыкталган жалпы учурларды эске алганда 40%га жакыны), андан кийин Эмилия Романья (13,5%) экенин көрсөтүп турат. , Пьемонт (10,5%) жана Венето (10%).[2]По өрөөнүнүн бул төрт аймагы Италияда катталган жалпы өлүмдөрдүн 80% жана интенсивдүү терапия бөлүмдөрүнө түшкөндөрдүн 65% түзөт.[2]
Гарвард Коомдук Саламаттыкты сактоо мектеби тарабынан жүргүзүлгөн изилдөө АКШдагы COVID-19дан улам PM концентрациясынын көбөйүшү менен өлүмдүн деңгээлинин ортосундагы байланышты ырастап жаткандай көрүнөт[4] Мурунку байланыштарда биз SARS-CoV-2 ыктымалдыгын гипотеза кылганбыз. вирус инфекциянын таралышы учурунда бөлүкчөлөрүндө (PM) болушу мүмкүн, [5,6] буга чейин далилдер менен ырааттуу
башка вирустар үчүн жеткиликтүү.[7-15] Бирок, абадагы PM менен байланышкан микробиома маселеси, айрыкча шаардык чөйрөдө, негизинен аз изилденген бойдон калууда [16] жана - азыркы учурда - эч ким дагы эле атайын багытталган эксперименталдык изилдөөлөрдү жүргүзө элек. PMде SARS-CoV-2 бар экендигин тастыктоодо же жокко чыгарууда.
Бул жерде биз Бергамо провинциясынын өнөр жай аянтынан 21-февралдан мартка чейин 3 жумалык үзгүлтүксүз эки башка үлгүдөгү аба үлгүсүндөгү PM10 үлгүсүндөгү 34 PM10 үлгүсүнө жасаган анализдердин биринчи жыйынтыктарын сунуштайбыз. 13th.
Пан жана башкалар сүрөттөгөн методологиядан кийин.2019-жылы (абадагы вирустарды чогултуу, бөлүкчөлөрдүн өлчөмүн аныктоо жана аныктоо үчүн),[17] PM үлгүлөрү EN12341 эталондук методуна ылайык аз көлөмдөгү гравиметриялык аба үлгү алгычты (23 саатка 38,3 л/мин) колдонуу менен кварц була чыпкаларында чогултулган. :2014 PM10 мониторинги үчүн.Бөлчөкчөлөр 99,9% типтүү фильтрлерге камалып калганаэрозолду кармап туруу, туура сакталат жана Триест университетинин Колдонмо жана Салыштырмалуу Геномика лабораториясына жеткирилет.ДНК полимеразаларынын ингибиторлоруна бай болгон үлгүнүн “экологиялык” мүнөзүн эске алып, биз чыпкалардын түрүнө ылайыкташтырылган Quick RNA фекалдык топурак микробунун комплектин колдонуу менен РНКны экстракциялоону уланттык.[18]Жарым фильтр тоголоктолгон, үстү жагы ичине каратылган,5 мл полипропилен түтүктө, комплектте берилген мончоктор менен бирге.Алгачкы 1 мл лизисбуферден биз 400 улга жакын эритмени ала алдык, андан кийин ал стандарттык протоколдордо аныкталгандай иштетилип, натыйжада 15 ul акыркы элюат болду.Кийинчерээк, 5 ul SARS-CoV-2 тестирлөө үчүн колдонулган.Үлгүнүн өзгөчө келип чыгышын эске алуу менен, qScript XLT 1-Step RT-qPCR ToughMix колдонулган.[19]Күчөтүү системалары ДСУнун веб-сайтында жарыяланган Корман жана башкалар тарабынан иштелип чыккан протоколдун системалары болгон [20].
Сыноо ачык бөлүкчөлөрдөгү SARS-CoV-2 РНКсынын бар экендигин тастыктоого же жокко чыгарууга багытталган.Биринчи талдоо молекулярдык маркер катары “Е генин” колдонгон жана 16 фильтрдин 15инде таасирдүү оң натыйжа берген, ал тургай, биз күткөндөй, Ct 36-38 циклдин ортосунда болсо да.
Андан кийин, биз SARS-CoV-2 үчүн абдан өзгөчө болгон молекулярдык маркер катары "RtDR генин" колдонуу менен 6 оң чыпкага ("E генге" оң болгон) анализди кайталадык - 5 маанилүү натыйжага жетти. позитивдүүлүк;жалган позитивди жокко чыгаруу үчүн контролдук тесттер да ийгиликтүү аткарылды (1-сүрөт).
Калган алынган РНКлар жергиликтүү университеттин ооруканасына (Италия өкмөтү SARS-CoV-2 диагностикалык сыноолорун жүргүзүүгө уруксат берген клиникалык борборлордун бири) экинчи иретке келтирүү үчүн жеткирилген. параллелдүү сокур сыноо.Бул экинчи клиникалык лаборатория E, N жана RdRP гендери үчүн 34 РНК экстракциясын сынап, үч маркер генинин жок дегенде бирөөсү үчүн 7 оң натыйжаларды билдирди, позитивдүүлүк бардык үч маркер үчүн өзүнчө тастыкталды (сүрөт 2).Үлгүнүн табиятынан улам жана үлгү алуу клиникалык диагностикалык максаттарда эмес, айлана-чөйрөнүн булганышын текшерүү үчүн жүргүзүлгөндүгүн эске алуу менен (ошондой эле фильтрлер молекулярдык-генетикалык анализден өткөнгө чейин кеминде төрт жума сакталганын эске алуу менен, ошондой элеИталиянын жабылышынын кесепети), биз 8 фильтрде өтө спецификалык "RtDR генин" аныктоо менен SARS-CoV-2 вирустук РНКсынын бар экендигин негиздүү далилдей алабыз.Бирок, чыпкалардан кошумча материалдардын жоктугунан улам, биз бир эле учурда бардык 3 молекулярдык маркердин позитивдүүлүгүн көрсөтүү үчүн жетиштүү сандагы сыноолорду кайталай алган жокпуз.
Бул SARS-CoV-2 РНКсы сырттагы бөлүкчөлөрдө болушу мүмкүн экендигинин биринчи алдын ала далили, бул атмосфералык туруктуулуктун жана PMнин жогорку концентрациясынын шарттарында SARS-CoV-2 сырттагы PM менен кластерлерди түзүшү мүмкүн жана - тарабынан алардын диффузиялык коэффициентин азайтуу – атмосферада вирустун туруктуулугун жогорулатуу.Бул алдын ала кошумча ырастооДалилдер уланууда жана SARS-CoV-2нин жашоо жөндөмдүүлүгүнө, ошондой эле бөлүкчөлөргө адсорбцияланганда анын вируленттүүлүгүнө реалдуу убакыт режиминде баа берүүнү камтышы керек.Учурда PMде вирустун болушу менен COVID-19 эпидемиясынын прогрессинин ортосундагы корреляцияга байланыштуу эч кандай божомол жасоо мүмкүн эмес.Атайын чечиле турган башка маселелер, акыры, PMдин орточо концентрациясыжугуштуу оорунун потенциалдуу "күчтүү эффекти" үчүн талап кылынат (эгерде PM вирустук тамчылардын өзөктөрү үчүн "ташуучу" катары иш алып барышы мүмкүн экендиги тастыкталган учурда), ал тургай ПМнын төмөнкү босогосунда минималдуу дозанын таасиринен улам иммунизациялоонун теориялык мүмкүнчүлүгү. .
Fig.1 E (A) жана RdRP гендердин (B) күчөтүү ийри сызыктары: жашыл сызыктар текшерилген чыпкаларды билдирет;кайчылаш сызыктаршилтеме чыпкасы экстракцияларды билдирет;кызыл сызыктар оң үлгүлөрдүн күчөшүн билдирет.
Fig.2.Бардык 34 PM10 үлгүсү үчүн алынган E, N жана RdRP гендери үчүн оң натыйжалар (X менен белгиленген)фильтрлер экинчи параллелдүү анализдерде сыналган.
Леонардо Сетти1, Фабрицио Пассарини2, Джанлуиджи Де Женнаро3, Пьерлуиджи Барбиери4, Мария Грациа Перроне5, Массимо Борелли6, Жоланда Палмисани3, Алессия Ди Гилио3, Валентина Торболи6, Альберто Паллавичини6, Маурицио А.
1. Өнөр жай химиясы, Болонья университети, Виале дель Рисоргименто – 4, I-40136, Болонья, Италия
e-mail: leonardo.setti@unibo.it
2. «Кайра жаралуучу булактар, курчап турган чөйрө, көгүлтүр өсүү, энергетика» Ведомстволор аралык өнөр жай изилдөө борбору
University of Bologna, Rimini, Italy e-mail: fabrizio.passarini@unibo.it
3. Бари, Бари, Италия, «Альдо Моро» университетинин биология бөлүмү
e-mail: gianluigi.degennaro@uniba.it; alessia.digilio@uniba.it; jolanda.palmisani@uniba.it
4. Химия жана фармацевтика илимдери бөлүмү, Триест университети, Триест, Италия
e-mail: barbierp@units.it
5. Айлана-чөйрөнү изилдөө бөлүмү, TCR TECORA, Милан, Италия
e-mail: mariagrazia.perrone@tcrtecora.com
6. Жашоо илимдери бөлүмү – Триест университети, Триест, Италия
e-mail: borelli@units.it; torboli@units.it; pallavic@units.it
7. Лабораториялык медицина бөлүмү, Джулиано Исонтина университетинин ооруканасы (ASU GI), Триест, Италия
email: maurizio.ruscio@asugi.sanita.fvg.it
8. Италиялык экологиялык медицина коому (SIMA), Милан, Италия
e-mail: priscofreedom@hotmail.com; alessandro.miani@unimi.it
9. Милан университетинин Айлана-чөйрөнү коргоо илими жана поици бөлүмү, Милан, Италия
e-mail: priscofreedom@hotmail.com; alessandro.miani@unimi.it
Корреспондент:
Леонардо Сетти, Department of Industrial Chemistry, University of Bologna Viale del Risorgimento 4, 40136, Bologna, Italy; e-mail: leonardo.setti@unibo.it
Шилтемелер
1. Дүйнөлүк Саламаттыкты сактоо Уюму, COVID-19ду пайда кылуучу вирустун жугуу жолдору: ЭПКнын сактык боюнча сунуштарына тийгизген таасири, Илимий кыскача маалымат;жеткиликтүү: https://www.who.int/newsroom/commentaries/detail/modes-of-transmission-of-virus-causing-covid-19-implications-for-ipcprecaution-recommendations (29-март, 2020-жыл)
2. Италиянын Саламаттыкты сактоо министрлиги, Италиядагы Covid-19 эпидемиясынын күнүмдүк бюллетени, http://www.salute.gov.it/imgs/C_17_notizie_4451_0_file.pdf дареги боюнча жеткиликтүү
3. EEA, Европанын айлана-чөйрөнү коргоо агенттиги, Европадагы абанын сапаты 2019-жылдагы отчету;№ 10/2019;Айлана-чөйрөнү коргоо боюнча Европа агенттиги: Копенгаген, Дания, жеткиликтүү: https://www.eea.europa.eu/publications/airquality-in-europe-2019
4. Xiao Wu, Rachel C. Nethery, M. Benjamin Sabath, Danielle Braun, Francesca Dominici, Exposure to the air булгануу жана COVID-19 өлүмү АКШда, жеткиликтүү: https://projects.iq.harvard.edu/ files/covid-pm/files/pm_and_covid_mortality.pdf
5. Италиялык экологиялык медицина коому (SIMA), Position Paper Particulate Matter жана COVID-19,
жеткиликтүү: http://www.simaonlus.it/wpsima/wp-content/uploads/2020/03/COVID_19_positionpaper_ENG.pdf
6. Setti L., Passarini F., De Gennaro G., Barbieri P., Perrone MG, Piazzalunga A., Borelli M., Palmisani J., Di Gilio A, Piscitelli P, Miani A., "Правдалуу роль барбы?" Түндүк Италияда COVID-19 таралышындагы бөлүкчөлөр үчүн?, BMJ Rapid Responses, 2020-жылдын 8-апрелинде, жеткиликтүү: https://www.bmj.com/content/368/bmj.m1103/rapid-responses
7. Sedlmaier, N., Hoppenheidt, K., Krist, H., Lehmann, S., Lang, H., Buttner, M. Канаттуулардын тумоосунун вирусунун (AIV) булганган заңынын майда бөлүкчөлөрүнүн (PM2.5) генерациясы: геномду жана инфекцияны аныктоо жана иммиссияны эсептөө.Ветеринардык микробиология.139, 156-164 (2009)
8. Чжао, Ю., Ричардсон, Б., Такл, Э., Чай, Л., Шмитт, Д., Вин, H. 2015-жылы канаттуулардын тумоосунун жогорку патогендүү эпидемиясынын таралышында аба аркылуу жуккандар роль ойногон болушу мүмкүн. Америка Кошмо Штаттары.Sci Rep. 9, 11755. https://doi.org/10.1038/s41598-019-47788-z (2019)
9. Ма, Ю., Чжоу, Дж., Янг, С., Чжао, Ю., Чжэн, X. Кытайдын батышындагы кызамык оорусуна чаң окуяларынын таасирине баа берүү.Атмосфералык чөйрө.157, 1-9 (2017)
10. Sorensen, JH, Mackay, DKJ, Jensen, C. Ø., Donaldson, AI. Шарп вирусунун эпидемиолунун атмосфералык жайылышын алдын ала айтуу үчүн интеграцияланган модель.Инфекция., 124, 577–590 (2000)
11. Glostera, J., Alexandersen, S. New Directions: Шарп оорусунун аба аркылуу жугушу, Atmospheric Environment, 38 (3), 503-505 (2004)
12. Рече, И., Д'Орта, Г., Младенов, Н., Вингет, ДМ, Саттл, CA. Атмосфералык чек ара катмарынын үстүндө вирустар менен бактериялардын жайгашуу ылдамдыгы.ISME журналы.12, 1154-1162 (2018)
13. Цинь, Н., Лян, П., Ву, Ц., Ван, Г., Сю, К., Сионг, X., Ван, Т., Золфо, М., Сегата, Н., Цин, Н. ., Найт, Р., Гилберт, Ж.А., Жу, ТФ Мегаполисте бөлүкчөлөр менен байланышкан микробиоманы узунунан изилдөө.Геном биологиясы.21, 55 (2020)
14. Чжао, Ю., Ричардсон, Б., Такл, Э., Чай, Л., Шмитт, Д., Уин, Х. Аба-десанттык берүү болушу мүмкүн.
2015-жылы Америка Кошмо Штаттарында канаттуулар тумоосунун жогорку патогендүү эпидемиясынын жайылышына роль ойногон.Sci
Реп. 9, 11755. https://doi.org/10.1038/s41598-019-47788-z (2019)
15. Ма, Ю., Чжоу, Дж., Янг, С., Чжао, Ю., Чжэн, X. Кытайдын батышындагы кызамык оорусуна чаң окуяларынын таасирине баа берүү.Атмосфералык чөйрө.157, 1-9 (2017)
16. Jiang, W., Laing, P., Wang, B., Fang, J., Lang, J., Tian, G., Jiang, J., Zhu, TF Оптимизацияланган ДНКны экстракциялоо жана абадагы микробдук жамааттардын метагеномикалык секвенциясы .Нат.Проток.10, 768-779 (2015)
17. Pan, M., Lednicky, JA, Wu, C.-Y., Collection, бөлүкчөлөрдүн өлчөмү жана абадагы вирустарды аныктоо.Колдонмо микробиология журналы, 127, 1596-1611 (2019)
18. Zymoresearch Ldt, продукт сүрөттөлүшү, жеткиликтүү: https://www.zymoresearch.com/products/quick-rnafecal-soil-microbe microprep-kit
19. Quantabio Ltd, буюмдун сүрөттөлүшү, жеткиликтүү: https://www.quantabio.com/qscript-xlt-1-steprt-qpcr-toughmix
20. Корман, В.М., Ландт, О., Кайзер, М., Моленкамп, Р., Мейжер, А., Чу, ДК, & Мулдерс, DG (2020).
2019-жылдын жаңы коронавирусун (2019-nCoV) реалдуу убакыт режиминде RT-PCR аркылуу аныктоо.Eurosurveillance, 25(3), жеткиликтүү:.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6988269/
Түпнуска: https://doi.org/10.1101/2020.04.15.20065995
Билдирүү убактысы: 18-апрель, 2020