COVID-19 gaixotasuna izenez ezagutzen den arnas sindrome akutu larria (SARS-CoV-2 birusaren ondorioz) arnas tanten eta kontaktu estuen bidez hedatzen dela onartzen da.[1]COVID-19aren zama oso larria izan zen Lombardian eta Po haranean (Ipar Italia),[2], partikula-kontzentrazio altuak dituen eremuan, gizakien osasunean efektu negatiboak eragiten baitituzte dagoeneko.[3]Apirilaren 12an Italiarako eskuragarri dauden eskualdeko zifrek erakusten dute gaur egun positiboen % 30 inguru Lombardian bizi dela (% 40 inguru epidemiaren hasieratik baieztatutako kasu orokorrak kontuan hartuta), eta ondoren Emilia Romagna (% 13,5). , Piamonte (%10,5) eta Veneto (%10).[2]Po Haraneko lau eskualde hauek Italian erregistratutako heriotzen % 80 eta Zainketa Intentsiboetako Unitateen harreraren % 65 dira.[2]
Harvardeko Osasun Publikoko Eskolak egindako ikerketa batek AEBetan PM kontzentrazioaren igoeraren eta COVID-19aren ondoriozko hilkortasun-tasen arteko erlazioa baieztatzen duela dirudi. infekzioa hedatzean birusa egon liteke partikularen gainean (PM),[5,6] dagoeneko ebidentziarekin bat.
beste birus batzuentzat eskuragarri.[7-15] Hala ere, aireko PM-rekin lotutako mikrobiomaren gaia, batez ere hiri-inguruneetan, oraindik gutxi ikertzen jarraitzen du[16], eta, gaur egun, inork ez du oraindik berariaz zuzendutako ikerketa esperimentalrik egin. PM-etan SARS-CoV-2 presentzia baieztatzean edo baztertzean.
Hemen, Bergamoko probintziako industria gune bateko kanpoko/aireko PM10-ren 34 PM10 laginetan egin ditugun analisien lehen emaitzak aurkezten ditugu, bi aire-lagingailu ezberdinekin bildutako 3 asteko aldi jarraituan, otsailaren 21etik martxora bitartean. 13an.
Pan et al-ek deskribatutako metodologiari jarraituz.2019an (aireko birusak biltzeko, partikulen tamaina eta detektatzeko),[17] PM laginak kuartzozko zuntz-iragazkietan bildu ziren bolumen baxuko aire-lagingailu grabimetriko bat erabiliz (38,3 l/min 23 orduz), EN12341 erreferentzia metodoarekin bat datorrena. :2014 PM10 monitorizatzeko.Partikulak iragazkietan harrapatuta geratu ziren % 99,9ko ohikoarekinaerosolen atxikipena, behar bezala gordeta eta Trieste Unibertsitateko Genomika Aplikatu eta Konparatiboaren laborategira entregatuta.Laginaren “ingurumenaren” izaera kontuan hartuta, ustez ADN polimerasen inhibitzaileetan aberatsa dena, RNA erauzketari ekin genion, iragazki motari egokitutako Quick RNA fecal lur microbe kit-a erabiliz.[18]Iragazki erdia biribildu zen, goiko aldea barrurantz begira zuela,5 ml-ko polipropilenozko hodi batean, kitean emandako aleekin batera.Hasierako 1 ml lisi-tamponetik, 400 ul-ko disoluzio inguru lortu ahal izan genituen, gero protokolo estandarrek zehazten duten moduan prozesatu zena, 15 ul-ko azken eluatua lortuz.Ondoren, 5 ul erabili ziren SARS-CoV-2 probarako.Laginaren jatorri berezia kontuan hartuta, qScript XLT 1-Step RT-qPCR ToughMix erabili zen.[19]Anplifikazio sistemak Corman et al-ek garatutako protokoloarenak ziren, OMEren webgunean argitaratutakoak [20].
Proba esplizituki zuzenduta zegoen SARS-CoV-2 RNAren presentzia partikulen gainean baieztatzeko edo baztertzeko.Lehenengo analisiak "E genea" markatzaile molekular gisa erabili zuen eta emaitza positibo ikusgarria eman zuen 15 iragazkitik 15etan, nahiz eta, espero genuen bezala, Ct 36-38 ziklo artean egon.
Horren ostean, 6 iragazki positiboren azterketa errepikatu dugu (dagoeneko positiboa "E genearentzat") "RtDR genea" markatzaile molekular gisa erabiliz - SARS-CoV-2rentzat oso espezifikoa dena - 5 emaitza esanguratsu lortuz. positibotasuna;positibotasun faltsua baztertzeko kontrol-probak ere arrakastaz egin ziren (1. irudia).
Eskura dagoen laginketa-material urria agortzea saihesteko, ateratako gainerako RNAak tokiko Unibertsitate Ospitalera (Italiako Gobernuak SARS-CoV-2 diagnostiko probak egiteko baimendutako zentro klinikoetako bat) entregatu ziren, bigarren bat egiteko. proba itsu paraleloa.Bigarren laborategi kliniko honek E, N eta RdRP geneetarako 34 RNA erauzketa probatu zituen, hiru markatzaile-geneetako batentzat gutxienez 7 emaitza positiboren berri emanez, positibotasuna bereizita baieztatuta hiru markatzaileentzat (2. irudia).Laginaren izaera dela eta, eta kontuan hartuta laginketa ez dela diagnostiko klinikorako egin, ingurumenaren kutsadura-probak egiteko baizik (kontuan izanda ere iragazkiak gutxienez lau astez gorde zirela analisi genetiko molekularra egin aurretik, izan ereItaliako itxieraren ondorioa), SARS-CoV-2 RNA birikoaren presentzia arrazoiz frogatu dugula baieztatu dezakegu 8 iragazkitan "RtDR gene" oso espezifikoa detektatuz.Hala ere, iragazkien material gehigarririk ez zegoenez, ezin izan genituen 3 markatzaile molekular guztien positibotasuna erakusteko nahikoa proba errepikatu aldi berean.
Hauxe da SARS-CoV-2 RNA kanpoko partikulen gainean egon daitekeen lehen froga, eta horrela iradokitzen du, egonkortasun atmosferikoko baldintzetan eta PM-kontzentrazio handietan, SARS-CoV-2k kanpoko PMekin klusterrak sor ditzakeela eta, difusio-koefizientea murriztea - birusak atmosferan irautea hobetu.Aurretiazko berrespen gehiagofrogak etengabeak dira, eta denbora errealeko ebaluazioa sartu beharko lukete SARS-CoV-2-ren bizitasunari buruz, baita bere birulentziari buruzko gai partikulan xurgatzean.Gaur egun, ezin da hipotesirik egin birusaren presentziaren eta COVID-19 agerraldiaren progresioaren arteko korrelazioari buruz.Zehazki landu beharreko beste gai batzuk PMren batez besteko kontzentrazioa dira azkeneanBeharrezkoa da kutsaduraren "suspen-efektu" potentzial baterako (PM-k tanta biralaren nukleoen "eramaile" gisa jardun dezakeela baieztatzen bada), edo baita PMaren atalase baxuagoetan dosi minimoen esposizioaren ondorioz immunizazio aukera teorikoa ere. .
1. irudia E (A) eta RdRP geneen (B) anplifikazio-kurbak: marra berdeek probatutako iragazkiak adierazten dituzte;lerro gurutzatuakerreferentzia-iragazkien erauzketak adierazten ditu;marra gorriak lagin positiboen anplifikazioa adierazten du.
2. irudia.Emaitza positiboak (X-rekin markatuta) 34 PM10 lagin guztietarako lortutako E, N eta RdRP geneentzatbigarren analisi paraleloetan probatutako iragazkiak.
Leonardo Setti1, Fabrizio Passarini2, Gianluigi De Gennaro3, Pierluigi Barbieri4, Maria Grazia Perrone5, Massimo Borelli6, Jolanda Palmisani3, Alessia Di Gilio3, Valentina Torboli6, Alberto Pallavicini6, Maurizio Ruscio7, Prisco Piscitelli8, Alessandro Miani8,9
1. Industria Kimika Saila, Bolognako Unibertsitatea, Viale del Risorgimento – 4, I-40136, Bologna, Italia
e-mail: leonardo.setti@unibo.it
2. “Iturburu Berriztagarriak, Ingurumena, Hazkunde Urdina, Energia” Ikerketa Industrialerako Departamentu arteko Zentroa.
University of Bologna, Rimini, Italy e-mail: fabrizio.passarini@unibo.it
3. Biologia Saila, Bariko “Aldo Moro” Unibertsitatea, Bari, Italia
e-mail: gianluigi.degennaro@uniba.it; alessia.digilio@uniba.it; jolanda.palmisani@uniba.it
4. Kimika eta Farmazia Zientzien Saila, Triesteko Unibertsitatea, Trieste, Italia
e-mail: barbierp@units.it
5. Ingurumen Ikerketa Saila, TCR TECORA, Milan, Italia
e-mail: mariagrazia.perrone@tcrtecora.com
6. Bizitza Zientzien Saila – Triesteko Unibertsitatea, Trieste, Italia
e-mail: borelli@units.it; torboli@units.it; pallavic@units.it
7. Laborategiko Medikuntza Dibisioa, Giuliano Isontina Unibertsitate Ospitalea (ASU GI), Trieste, Italia
email: maurizio.ruscio@asugi.sanita.fvg.it
8. Italiako Ingurumen Medikuntzako Elkartea (SIMA), Milan, Italia
e-mail: priscofreedom@hotmail.com; alessandro.miani@unimi.it
9. Ingurugiro Zientzia eta Poicy Saila, Milango Unibertsitatea, Milan, Italia
e-mail: priscofreedom@hotmail.com; alessandro.miani@unimi.it
Dagokion egilea:
Leonardo Setti, Department of Industrial Chemistry, University of Bologna Viale del Risorgimento 4, 40136, Bologna, Italy; e-mail: leonardo.setti@unibo.it
Erreferentziak
1. Osasunaren Mundu Erakundea, COVID-19 eragiten duten birusak transmititzeko moduak: IPCren prebentzio-gomendioetarako ondorioak, Laburpen zientifikoa;Hemen eskuragarri: https://www.who.int/newsroom/commentaries/detail/modes-of-transmission-of-virus-causing-covid-19-implications-for-ipcprecaution-recommendations (2020ko martxoaren 29a)
2. Italiako Osasun Ministerioa, Italiako Covid-19 agerraldiaren eguneroko buletina, http://www.salute.gov.it/imgs/C_17_notizie_4451_0_file.pdf helbidean eskuragarri.
3. EEE, Europako Ingurumen Agentzia, Air Quality in Europe 2019 txostena;10/2019 zenbakia;Europako Ingurumen Agentzia: Kopenhage, Danimarka, eskuragarri hemen: https://www.eea.europa.eu/publications/airquality-in-europe-2019
4. Xiao Wu, Rachel C. Nethery, M. Benjamin Sabath, Danielle Braun, Francesca Dominici, Exposure to air pollution and COVID-19 mortality in the United States, hemen eskuragarri: https://projects.iq.harvard.edu/ files/covid-pm/files/pm_and_covid_mortality.pdf
5. Italiako Ingurumen Medikuntzako Elkartea (SIMA), Position Paper Partikula Materia eta COVID-19,
Hemen eskuragarri: http://www.simaonlus.it/wpsima/wp-content/uploads/2020/03/COVID_19_positionpaper_ENG.pdf
6. Setti L., Passarini F., De Gennaro G., Barbieri P., Perrone MG, Piazzalunga A., Borelli M., Palmisani J., Di Gilio A, Piscitelli P, Miani A., Ba al dago rol sinesgarririk Partikularen materiarako COVID-19aren hedapenean Italia iparraldean?, BMJ Rapid Responses, 2020ko apirilaren 8an, eskuragarri: https://www.bmj.com/content/368/bmj.m1103/rapid-responses
7. Sedlmaier, N., Hoppenheidt, K., Krist, H., Lehmann, S., Lang, H., Buttner, M. Hegaztien gripearen birusa (AIV) kutsatutako fekalen partikula fina (PM2,5): genoma eta infektibitatea detektatzea eta inmisioaren kalkulua.Albaitaritza Mikrobiologia.139, 156-164 (2009)
8. Zhao, Y., Richardson, B., Takle, E., Chai, L., Schmitt, D., Win, H. Baliteke aire bidezko transmisioak 2015eko hegazti-gripe oso patogenoaren agerraldien hedapenean izan zezakeela. Ameriketako Estatu Batuak.Sci Rep. 9, 11755. https://doi.org/10.1038/s41598-019-47788-z (2019)
9. Ma, Y., Zhou, J., Yang, S., Zhao, Y., Zheng, X. Hauts-gertakariek elgorriaren intzidentzian Txina mendebaldean duten eraginari buruzko ebaluazioa.Ingurune atmosferikoa.157, 1-9 (2017)
10. Sorensen, JH, Mackay, DKJ, Jensen, C. Ø., Donaldson, AI Epidemiol epidemiolen epidemiolen birusaren hedapen atmosferikoa aurreikusteko eredu integratua.Infect., 124, 577–590 (2000)
11. Glostera, J., Alexandersen, S. New Directions: Airborne Transmission of Foot-and-Mouth Disease Virus Atmospheric Environment, 38 (3), 503-505 (2004)
12. Reche, I., D'Orta, G., Mladenov, N., Winget, DM, Suttle, CA Muga geruzaren gaineko birusen eta bakterioen deposizio-tasa.ISME aldizkaria.1154-1162 (2018)
13. Qin, N., Liang, P., Wu, C., Wang, G., Xu, Q., Xiong, X., Wang, T., Zolfo, M., Segata, N., Qin, H. ., Knight, R., Gilbert, JA, Zhu, TF Megahiri bateko materia partikularekin lotutako mikrobiomaren inkesta longitudinala.Genoma Biologia.21, 55 (2020)
14. Zhao, Y., Richardson, B., Takle, E., Chai, L., Schmitt, D., Win, H. Airborne transmisioa izan daiteke
2015ean oso patogenoa den hegazti-gripearen agerraldien hedapenean zeresana izan zuen Estatu Batuetan.Zientzia
Rep. 9, 11755. https://doi.org/10.1038/s41598-019-47788-z (2019)
15. Ma, Y., Zhou, J., Yang, S., Zhao, Y., Zheng, X. Hauts-gertakariek Txinako mendebaldeko elgorriaren intzidentzian duten eraginari buruzko ebaluazioa.Ingurune atmosferikoa.157, 1-9 (2017)
16. Jiang, W., Laing, P., Wang, B., Fang, J., Lang, J., Tian, G., Jiang, J., Zhu, TF Aire bidezko mikrobio-komunitateen DNA erauzketa optimizatua eta sekuentziazio metagenomikoa .Nat.Protok.10, 768-779 (2015)
17. Pan, M., Lednicky, JA, Wu, C.-Y., Bilketa, partikulen tamaina eta aireko birusen detekzioa.Mikrobiologia Aplikatuaren Aldizkaria, 127, 1596-1611 (2019)
18. Zymoresearch Ldt, produktuaren deskribapena, hemen eskuragarri: https://www.zymoresearch.com/products/quick-rnafecal-soil-microbe microprep-kit
19. Quantabio Ltd, produktuaren deskribapena, hemen eskuragarri: https://www.quantabio.com/qscript-xlt-1-steprt-qpcr-toughmix
20. Corman, VM, Landt, O., Kaiser, M., Molenkamp, R., Meijer, A., Chu, DK eta Mulders, DG (2020).
2019ko koronavirus berriaren detekzioa (2019-nCoV) denbora errealeko RT-PCR bidez.Eurosurveillance, 25(3), hemen eskuragarri:.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6988269/
Jatorrizkoa: https://doi.org/10.1101/2020.04.15.20065995
Argitalpenaren ordua: 2020-04-18