SARS-CoV-2 virusuna görə, COVID-19 xəstəliyi kimi tanınan ağır kəskin respirator sindromun tənəffüs damcıları və yaxın təmaslar vasitəsilə yayıldığı tanınır.[1]COVID-19-un yükü Lombardiya və Po Vadisində (Şimali İtaliya),[2] yüksək konsentrasiyalı hissəciklər ilə xarakterizə olunan və artıq insan sağlamlığına mənfi təsir göstərdiyi məlum olan ərazidə son dərəcə ağır idi.[3]12 aprel tarixində İtaliya üçün mövcud olan regional rəqəmlər göstərir ki, hazırda müsbət insanların təxminən 30% -i hələ də Lombardiyada yaşayır (epidemiyanın əvvəlindən təsdiqlənmiş ümumi halları nəzərə alsaq, təxminən 40%), sonra Emilia Romagna (13,5%). , Piedmont (10,5%) və Veneto (10%).[2]Po Vadisinin bu dörd bölgəsi İtaliyada qeydə alınan ümumi ölümlərin 80%-ni və Reanimasiya şöbələrinə daxil olanların 65%-ni təşkil edir.[2]
Harvard Xalq Sağlamlığı Məktəbi tərəfindən aparılan bir araşdırma, ABŞ-da COVID-19 səbəbiylə PM konsentrasiyalarının artması ilə ölüm nisbətləri arasında əlaqəni təsdiqləyir[4] Əvvəlki ünsiyyətlərdə biz SARS-CoV-2 ehtimalını fərz etmişdik. virus infeksiyanın yayılması zamanı hissəciklərin (PM) üzərində mövcud ola bilər,[5,6] artıq sübutlarla ardıcıl olaraq
digər viruslar üçün də mövcuddur.[7-15] Bununla belə, havada PM ilə əlaqəli mikrobiom məsələsi, xüsusən də şəhər mühitlərində, əsasən az tədqiq edilməmiş qalır,[16] və hal-hazırda heç kim xüsusi olaraq təcrübi tədqiqatlar aparmamışdır. PM-də SARS-CoV-2-nin mövcudluğunu təsdiqləyən və ya istisna edən zaman.
Burada, 21 fevraldan mart ayına qədər 3 həftəlik fasiləsiz müddət ərzində iki fərqli hava nümunəsi ilə toplanmış Berqamo əyalətinin sənaye yerindən açıq havada/havada PM10 34 PM10 nümunəsi üzərində apardığımız analizlərin ilk nəticələrini təqdim edirik. 13.
Pan və başqalarının təsvir etdiyi metodologiyaya uyğun olaraq.2019-cu ildə (toplanması, hissəcik ölçüsünün ölçülməsi və hava-damcı viruslarının aşkarlanması üçün),[17] PM nümunələri EN12341 istinad metoduna uyğun olaraq aşağı həcmli qravimetrik hava nümunə götürən (23 saat ərzində 38,3 l/dəq) istifadə edərək kvars lifli filtrlərdə toplanmışdır. : PM10 monitorinqi üçün 2014.Zərrəciklər 99,9% tipik olaraq filtrlərin üzərinə yığılıbaerozol tutma, düzgün saxlanılır və Trieste Universitetinin Tətbiqi və Müqayisəli Genomika laboratoriyasına çatdırılır.Nümunənin, ehtimal ki, DNT polimerazalarının inhibitorları ilə zəngin olan “ekoloji” təbiətini nəzərə alaraq, filtrlərin növünə uyğunlaşdırılmış Quick RNT nəcisli torpaq mikrob dəstindən istifadə etməklə RNT-nin çıxarılmasına davam etdik.[18]Yarım filtr yuxarı tərəfi içəriyə baxaraq yuvarlandı,dəstdə verilmiş muncuqlarla birlikdə 5 ml polipropilen boruda.İlkin 1 ml lizisbuferdən təxminən 400 ul məhlul əldə edə bildik, daha sonra standart protokollarla müəyyən edilmiş şəkildə emal edildi və nəticədə 15 ul yekun eluat əldə edildi.Daha sonra SARS-CoV-2 testi üçün 5 ul istifadə edildi.Nümunənin xüsusi mənşəyini nəzərə alaraq, qScript XLT 1-Step RT-qPCR ToughMix istifadə edilmişdir.[19]Gücləndirmə sistemləri ÜST-nin saytında dərc edilmiş Corman və digərləri tərəfindən hazırlanmış protokolun sistemləri idi [20].
Test açıq şəkildə SARS-CoV-2 RNT-nin hissəciklər üzərində mövcudluğunu təsdiqləmək və ya istisna etmək məqsədi daşıyırdı.İlk analiz molekulyar marker kimi “E genindən” istifadə etdi və gözlədiyimiz kimi Ct 36-38 dövr arasında olsa belə, 16 filtrdən 15-də təsirli müsbət nəticə verdi.
Bundan sonra, SARS-CoV-2 üçün yüksək spesifik olan “RtDR genindən” molekulyar marker kimi istifadə edərək müsbət filtrlərdən 6-sı (“E geninə” artıq müsbətdir) üzrə analizi təkrarladıq və 5 əhəmiyyətli nəticəyə çatdıq. pozitivlik;yanlış pozitivliyi istisna etmək üçün nəzarət testləri də uğurla həyata keçirilmişdir (şək. 1).
Mövcud olan az miqdarda nümunə götürmə materialının tükənməsinin qarşısını almaq üçün, qalan çıxarılan RNT-lər ikinci bir sınaq keçirmək üçün yerli Universitet Xəstəxanasına (İtaliya Hökuməti tərəfindən SARS-CoV-2 diaqnostik testləri üçün icazə verilmiş klinik mərkəzlərdən biri) çatdırıldı. paralel kor test.Bu ikinci kliniki laboratoriya E, N və RdRP genləri üçün 34 RNT ekstraksiyasını sınaqdan keçirmiş, üç marker genindən ən azı biri üçün 7 müsbət nəticə bildirmişdir, müsbətlik hər üç marker üçün ayrıca təsdiq edilmişdir (Şəkil 2).Nümunənin təbiətinə görə və nümunə götürmənin klinik diaqnostik məqsədlər üçün deyil, ətraf mühitin çirklənməsi testləri üçün aparıldığını nəzərə alaraq (həmçinin filtrlərin molekulyar genetik analizlərdən keçməzdən əvvəl ən azı dörd həftə saxlandığını nəzərə alaraq,İtaliyanın bağlanmasının nəticəsi), 8 filtrdə yüksək spesifik “RtDR geni” aşkar edərək SARS-CoV-2 viral RNT-nin mövcudluğunu əsaslı şəkildə nümayiş etdirdiyimizi təsdiqləyə bilərik.Bununla belə, filtrlərdən əlavə materialların olmaması səbəbindən bütün 3 molekulyar markerin eyni vaxtda müsbət olduğunu göstərmək üçün kifayət qədər sayda testi təkrarlaya bilmədik.
Bu, SARS-CoV-2 RNT-nin xarici hissəciklər üzərində ola biləcəyinə dair ilk ilkin sübutdur, beləliklə, atmosfer sabitliyi və PM-nin yüksək konsentrasiyası şəraitində SARS-CoV-2-nin açıq havada PM olan çoxluqlar yarada biləcəyini göstərir. onların diffuziya əmsalının azaldılması – virusun atmosferdə davamlılığını gücləndirir.Bu ilkin əlavə təsdiqlərsübutlar davam edir və SARS-CoV-2-nin canlılığı, həmçinin hissəciklər üzərində adsorbsiya edildikdə onun virulentliyi haqqında real vaxt qiymətləndirməsini əhatə etməlidir.Hazırda PM-də virusun olması ilə COVID-19 epidemiyasının inkişafı arasında korrelyasiya ilə bağlı heç bir fərziyyə irəli sürülə bilməz.Xüsusilə həll edilməli olan digər məsələlər, nəticədə PM-nin orta konsentrasiyasıdıryoluxmanın potensial “gücləndirici effekti” üçün tələb olunur (PM-nin viral damcı nüvələri üçün “daşıyıcı” rolunu oynaya biləcəyi təsdiqləndiyi təqdirdə) və ya hətta PM-nin aşağı hədlərində minimal dozaya məruz qalma nəticəsində immunizasiyanın nəzəri imkanı. .
Fig.1 E (A) və RdRP genlərinin (B) gücləndirmə əyriləri: yaşıl xətlər sınaqdan keçirilmiş filtrləri təmsil edir;çarpaz xətləristinad filtrinin çıxarılmasını təmsil edir;qırmızı xətlər müsbət nümunələrin gücləndirilməsini təmsil edir.
Şəkil 2.Bütün 34 PM10 nümunəsi üçün əldə edilmiş E, N və RdRP genləri üçün müsbət nəticələr (X ilə işarələnmişdir)filtrlər ikinci paralel analizlərdə sınaqdan keçirilmişdir.
Leonardo Setti1, Fabrizio Passarini2, Gianluigi De Gennaro3, Pierluici Barbieri4, Maria Qrasiya Perrone5, Massimo Borelli6, Jolanda Palmisani3, Alessia Di Gilio3, Valentina Torboli6, Alberto Pallavicini6, Maurizio Alessio Pidro89,
1. Sənaye Kimyası Departamenti, Bolonya Universiteti, Viale del Risorgimento – 4, I-40136, Bolonya, İtaliya
e-mail: leonardo.setti@unibo.it
2. “Bərpa olunan Mənbələr, Ətraf Mühit, Mavi İnkişaf, Enerji” Sənaye Tədqiqatları İdarələrarası Mərkəzi
University of Bologna, Rimini, Italy e-mail: fabrizio.passarini@unibo.it
3. Biologiya fakültəsi, Bari şəhəri, “Aldo Moro” Universiteti, Bari, İtaliya
e-mail: gianluigi.degennaro@uniba.it; alessia.digilio@uniba.it; jolanda.palmisani@uniba.it
4. Kimya və Əczaçılıq Elmləri Bölməsi, Trieste Universiteti, Triest, İtaliya
e-mail: barbierp@units.it
5. Ətraf Mühitin Tədqiqatları Bölməsi, TCR TECORA, Milan, İtaliya
e-mail: mariagrazia.perrone@tcrtecora.com
6. Həyat Elmləri Departamenti – Trieste Universiteti, Triest, İtaliya
e-mail: borelli@units.it; torboli@units.it; pallavic@units.it
7. Laboratoriya Tibb şöbəsi, Giuliano Isontina Universitet Xəstəxanası (ASU GI), Triest, İtaliya
email: maurizio.ruscio@asugi.sanita.fvg.it
8. İtalyan Ətraf Mühit Təbabəti Cəmiyyəti (SIMA), Milan, İtaliya
e-mail: priscofreedom@hotmail.com; alessandro.miani@unimi.it
9. Milan Universitetinin Ətraf Mühit Elmləri və Politika Departamenti, Milan, İtaliya
e-mail: priscofreedom@hotmail.com; alessandro.miani@unimi.it
Müəllif:
Leonardo Setti, Department of Industrial Chemistry, University of Bologna Viale del Risorgimento 4, 40136, Bologna, Italy; e-mail: leonardo.setti@unibo.it
İstinadlar
1. Ümumdünya Səhiyyə Təşkilatı, COVID-19-a səbəb olan virusun ötürülmə üsulları: IPC ehtiyat tövsiyələri üçün təsirlər, Elmi qısa məlumat;burada mövcuddur: https://www.who.int/newsroom/commentaries/detail/modes-of-transmission-of-virus-causing-covid-19-implications-for-ipcprecaution-recommendations (29 Mart 2020)
2. İtaliya Səhiyyə Nazirliyi, İtaliyada gündəlik Covid-19 epidemiyası bülleteni, http://www.salute.gov.it/imgs/C_17_notizie_4451_0_file.pdf ünvanında mövcuddur
3. AEA, Avropa Ətraf Mühit Agentliyi, Avropada Havanın Keyfiyyəti 2019 Hesabatı;№ 10/2019;Avropa Ətraf Mühit Agentliyi: Kopenhagen, Danimarka, əldə edə bilərsiniz: https://www.eea.europa.eu/publications/airquality-in-europe-2019
4. Xiao Vu, Rachel C. Nethery, M. Benjamin Sabath, Danielle Braun, Francesca Dominici, Exposure to air çirklənməsi və COVID-19 ölümləri ABŞ-da, əldə etmək olar: https://projects.iq.harvard.edu/ files/covid-pm/files/pm_and_covid_mortality.pdf
5. İtalyan Ətraf Mühit Təbabəti Cəmiyyəti (SIMA), Position Paper Particulate Matter və COVID-19,
burada mövcuddur: http://www.simaonlus.it/wpsima/wp-content/uploads/2020/03/COVID_19_positionpaper_ENG.pdf
6. Setti L., Passarini F., De Gennaro G., Barbieri P., Perrone MG, Piazzalunga A., Borelli M., Palmisani J., Di Gilio A, Piscitelli P, Miani A., Münasib rol varmı? Şimali İtaliyada COVID-19-un yayılmasında Particulate Matter for?, BMJ Rapid Responses, 8 aprel 2020-ci il, burada mövcuddur: https://www.bmj.com/content/368/bmj.m1103/rapid-responses
7. Sedlmaier, N., Hoppenheidt, K., Krist, H., Lehmann, S., Lang, H., Buttner, M. Quş qripi virusunun (AIV) nəsli ilə çirklənmiş nəcisli incə hissəciklər (PM2.5): genom və yoluxuculuğun aşkarlanması və immissiyanın hesablanması.Baytarlıq Mikrobiologiyası.139, 156-164 (2009)
8. Zhao, Y., Richardson, B., Takle, E., Chai, L., Schmitt, D., Win, H. Havadan ötürülmə 2015-ci ildə yüksək patogenli quş qripi epidemiyalarının yayılmasında rol oynamış ola bilər. Amerika Birləşmiş Ştatları.Sci Rep. 9, 11755. https://doi.org/10.1038/s41598-019-47788-z (2019)
9. Ma, Y., Zhou, J., Yang, S., Zhao, Y., Zheng, X. Çinin qərbində qızılca xəstəliyinə toz hadisələrinin təsirinin qiymətləndirilməsi.Atmosfer Mühiti.157, 1-9 (2017)
10. Sorensen, JH, Mackay, DKJ, Jensen, C. Ø., Donaldson, AI. Epidemiol dabaq xəstəliyi virusunun atmosferdə yayılmasını proqnozlaşdırmaq üçün inteqrasiya olunmuş model.İnfeksiya., 124, 577–590 (2000)
11. Glostera, J., Alexandersen, S. Yeni istiqamətlər: Ayaq və ağız xəstəliyinin havadan ötürülməsi virusu Atmosfer mühiti, 38 (3), 503-505 (2004)
12. Reche, I., D'Orta, G., Mladenov, N., Winget, DM, Suttle, CA Atmosferin sərhəd qatının üstündə virus və bakteriyaların çökmə dərəcələri.ISME jurnalı.12, 1154-1162 (2018)
13. Qin, N., Liang, P., Wu, C., Wang, G., Xu, Q., Xiong, X., Wang, T., Zolfo, M., Segata, N., Qin, H. ., Knight, R., Gilbert, JA, Zhu, TF Meqapolisdə hissəciklər ilə əlaqəli mikrobiomun uzununa tədqiqatı.Genom Biologiyası.21, 55 (2020)
14. Zhao, Y., Richardson, B., Takle, E., Chai, L., Schmitt, D., Win, H. Havadan ötürülmə ola bilər.
2015-ci ildə ABŞ-da yüksək patogenli quş qripi epidemiyalarının yayılmasında rol oynamışdır.Sci
Rep. 9, 11755. https://doi.org/10.1038/s41598-019-47788-z (2019)
15. Ma, Y., Zhou, J., Yang, S., Zhao, Y., Zheng, X. Çinin qərbində qızılca xəstəliyinə toz hadisələrinin təsirinin qiymətləndirilməsi.Atmosfer Mühiti.157, 1-9 (2017)
16. Jiang, W., Laing, P., Wang, B., Fang, J., Lang, J., Tian, G., Jiang, J., Zhu, TF Optimized DNT hasilatı və havadakı mikrob icmalarının metagenomik ardıcıllığı .Nat.Protok.10, 768-779 (2015)
17. Pan, M., Lednicky, JA, Wu, C.-Y., Kolleksiya, hissəciklərin ölçülməsi və havadakı virusların aşkarlanması.Tətbiqi Mikrobiologiya Jurnalı, 127, 1596-1611 (2019)
18. Zymoresearch Ldt, məhsul təsviri, burada mövcuddur: https://www.zymoresearch.com/products/quick-rnafecal-soil-microbe microprep-kit
19. Quantabio Ltd, məhsulun təsviri, burada mövcuddur: https://www.quantabio.com/qscript-xlt-1-steprt-qpcr-toughmix
20. Corman, VM, Landt, O., Kaiser, M., Molenkamp, R., Meijer, A., Chu, DK, & Mulders, DG (2020).
Real vaxt rejimində RT-PCR ilə 2019-cu ilin yeni koronavirusunun (2019-nCoV) aşkarlanması.Eurosurveillance, 25(3), burada mövcuddur:.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6988269/
Orijinal: https://doi.org/10.1101/2020.04.15.20065995
Göndərmə vaxtı: 18 aprel 2020-ci il